Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
TNS3Q68CZ2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TNS3Q68CZ2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
TNS3Q68CZ2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TNS3Q68CZ2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.72■■■■□ 3.15
TNS3Q68CZ2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TNS3Q68CZ2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TNS3Q68CZ2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TNS3Q68CZ2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TNS3Q68CZ2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
TNS3Q68CZ2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
TNS3Q68CZ2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
TNS3Q68CZ2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC34.7■■■■□ 3.15
TNS3Q68CZ2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
TNS3Q68CZ2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TNS3Q68CZ2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TNS3Q68CZ2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TNS3Q68CZ2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
TNS3Q68CZ2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TNS3Q68CZ2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
TNS3Q68CZ2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TNS3Q68CZ2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TNS3Q68CZ2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
TNS3Q68CZ2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
TNS3Q68CZ2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TNS3Q68CZ2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
TNS3Q68CZ2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TNS3Q68CZ2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TNS3Q68CZ2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
TNS3Q68CZ2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
TNS3Q68CZ2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
TNS3Q68CZ2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
TNS3Q68CZ2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
TNS3Q68CZ2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
TNS3Q68CZ2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
TNS3Q68CZ2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
TNS3Q68CZ2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
TNS3Q68CZ2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
TNS3Q68CZ2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
TNS3Q68CZ2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TNS3Q68CZ2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
TNS3Q68CZ2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC34.61■■■■□ 3.13
TNS3Q68CZ2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
TNS3Q68CZ2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TNS3Q68CZ2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TNS3Q68CZ2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TNS3Q68CZ2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TNS3Q68CZ2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
TNS3Q68CZ2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.13
TNS3Q68CZ2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
TNS3Q68CZ2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
TNS3Q68CZ2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
TNS3Q68CZ2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
TNS3Q68CZ2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
TNS3Q68CZ2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
TNS3Q68CZ2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
TNS3Q68CZ2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
TNS3Q68CZ2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
TNS3Q68CZ2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
TNS3Q68CZ2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
TNS3Q68CZ2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
TNS3Q68CZ2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
TNS3Q68CZ2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
TNS3Q68CZ2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
TNS3Q68CZ2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
TNS3Q68CZ2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
TNS3Q68CZ2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
TNS3Q68CZ2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC34.51■■■■□ 3.12
TNS3Q68CZ2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
TNS3Q68CZ2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
TNS3Q68CZ2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TNS3Q68CZ2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TNS3Q68CZ2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TNS3Q68CZ2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TNS3Q68CZ2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TNS3Q68CZ2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TNS3Q68CZ2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
TNS3Q68CZ2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TNS3Q68CZ2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TNS3Q68CZ2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TNS3Q68CZ2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
TNS3Q68CZ2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TNS3Q68CZ2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
TNS3Q68CZ2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
TNS3Q68CZ2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
TNS3Q68CZ2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TNS3Q68CZ2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
TNS3Q68CZ2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
TNS3Q68CZ2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
TNS3Q68CZ2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TNS3Q68CZ2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TNS3Q68CZ2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TNS3Q68CZ2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
TNS3Q68CZ2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
TNS3Q68CZ2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
TNS3Q68CZ2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
TNS3Q68CZ2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TNS3Q68CZ2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TNS3Q68CZ2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
TNS3Q68CZ2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms