Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZM2

RRAGB, Ras-related GTP-binding protein B, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGBQ5VZM2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRAGBQ5VZM2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRAGBQ5VZM2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRAGBQ5VZM2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRAGBQ5VZM2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRAGBQ5VZM2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRAGBQ5VZM2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRAGBQ5VZM2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RRAGBQ5VZM2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RRAGBQ5VZM2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RRAGBQ5VZM2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRAGBQ5VZM2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRAGBQ5VZM2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRAGBQ5VZM2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRAGBQ5VZM2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRAGBQ5VZM2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRAGBQ5VZM2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRAGBQ5VZM2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRAGBQ5VZM2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRAGBQ5VZM2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRAGBQ5VZM2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRAGBQ5VZM2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRAGBQ5VZM2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRAGBQ5VZM2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRAGBQ5VZM2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
RRAGBQ5VZM2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRAGBQ5VZM2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRAGBQ5VZM2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRAGBQ5VZM2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRAGBQ5VZM2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRAGBQ5VZM2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRAGBQ5VZM2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRAGBQ5VZM2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRAGBQ5VZM2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRAGBQ5VZM2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRAGBQ5VZM2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRAGBQ5VZM2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRAGBQ5VZM2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRAGBQ5VZM2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRAGBQ5VZM2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRAGBQ5VZM2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRAGBQ5VZM2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRAGBQ5VZM2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRAGBQ5VZM2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRAGBQ5VZM2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRAGBQ5VZM2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRAGBQ5VZM2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRAGBQ5VZM2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRAGBQ5VZM2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RRAGBQ5VZM2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RRAGBQ5VZM2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
RRAGBQ5VZM2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
RRAGBQ5VZM2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
RRAGBQ5VZM2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
RRAGBQ5VZM2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
RRAGBQ5VZM2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
RRAGBQ5VZM2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
RRAGBQ5VZM2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
RRAGBQ5VZM2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
RRAGBQ5VZM2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
RRAGBQ5VZM2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
RRAGBQ5VZM2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
RRAGBQ5VZM2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RRAGBQ5VZM2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RRAGBQ5VZM2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRAGBQ5VZM2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRAGBQ5VZM2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRAGBQ5VZM2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRAGBQ5VZM2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRAGBQ5VZM2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRAGBQ5VZM2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRAGBQ5VZM2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RRAGBQ5VZM2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RRAGBQ5VZM2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RRAGBQ5VZM2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RRAGBQ5VZM2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RRAGBQ5VZM2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RRAGBQ5VZM2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RRAGBQ5VZM2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RRAGBQ5VZM2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RRAGBQ5VZM2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RRAGBQ5VZM2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RRAGBQ5VZM2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRAGBQ5VZM2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRAGBQ5VZM2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRAGBQ5VZM2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRAGBQ5VZM2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RRAGBQ5VZM2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RRAGBQ5VZM2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RRAGBQ5VZM2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRAGBQ5VZM2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRAGBQ5VZM2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRAGBQ5VZM2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RRAGBQ5VZM2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRAGBQ5VZM2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRAGBQ5VZM2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRAGBQ5VZM2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRAGBQ5VZM2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRAGBQ5VZM2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RRAGBQ5VZM2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms