Protein–RNA interactions for Protein: Q5T619

ZNF648, Zinc finger protein 648, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF648Q5T619 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF648Q5T619 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF648Q5T619 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF648Q5T619 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF648Q5T619 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF648Q5T619 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF648Q5T619 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF648Q5T619 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF648Q5T619 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF648Q5T619 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF648Q5T619 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF648Q5T619 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF648Q5T619 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF648Q5T619 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF648Q5T619 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF648Q5T619 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF648Q5T619 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF648Q5T619 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF648Q5T619 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZNF648Q5T619 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF648Q5T619 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF648Q5T619 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF648Q5T619 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF648Q5T619 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF648Q5T619 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF648Q5T619 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF648Q5T619 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF648Q5T619 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF648Q5T619 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF648Q5T619 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF648Q5T619 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF648Q5T619 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF648Q5T619 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF648Q5T619 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF648Q5T619 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF648Q5T619 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF648Q5T619 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF648Q5T619 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF648Q5T619 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF648Q5T619 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF648Q5T619 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF648Q5T619 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF648Q5T619 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF648Q5T619 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF648Q5T619 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF648Q5T619 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF648Q5T619 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF648Q5T619 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF648Q5T619 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF648Q5T619 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF648Q5T619 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF648Q5T619 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF648Q5T619 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF648Q5T619 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF648Q5T619 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF648Q5T619 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF648Q5T619 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF648Q5T619 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF648Q5T619 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF648Q5T619 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF648Q5T619 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF648Q5T619 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF648Q5T619 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF648Q5T619 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF648Q5T619 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF648Q5T619 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF648Q5T619 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF648Q5T619 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF648Q5T619 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF648Q5T619 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF648Q5T619 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF648Q5T619 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF648Q5T619 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF648Q5T619 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF648Q5T619 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF648Q5T619 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF648Q5T619 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF648Q5T619 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF648Q5T619 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF648Q5T619 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZNF648Q5T619 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF648Q5T619 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF648Q5T619 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF648Q5T619 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF648Q5T619 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF648Q5T619 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF648Q5T619 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF648Q5T619 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF648Q5T619 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF648Q5T619 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF648Q5T619 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF648Q5T619 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF648Q5T619 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF648Q5T619 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF648Q5T619 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF648Q5T619 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF648Q5T619 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF648Q5T619 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF648Q5T619 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNF648Q5T619 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms