Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIVEP3Q5T1R4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIVEP3Q5T1R4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIVEP3Q5T1R4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIVEP3Q5T1R4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIVEP3Q5T1R4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIVEP3Q5T1R4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIVEP3Q5T1R4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIVEP3Q5T1R4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HIVEP3Q5T1R4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIVEP3Q5T1R4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIVEP3Q5T1R4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIVEP3Q5T1R4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIVEP3Q5T1R4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIVEP3Q5T1R4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HIVEP3Q5T1R4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIVEP3Q5T1R4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIVEP3Q5T1R4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIVEP3Q5T1R4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIVEP3Q5T1R4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HIVEP3Q5T1R4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HIVEP3Q5T1R4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HIVEP3Q5T1R4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIVEP3Q5T1R4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIVEP3Q5T1R4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HIVEP3Q5T1R4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIVEP3Q5T1R4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIVEP3Q5T1R4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HIVEP3Q5T1R4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIVEP3Q5T1R4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HIVEP3Q5T1R4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIVEP3Q5T1R4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIVEP3Q5T1R4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIVEP3Q5T1R4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HIVEP3Q5T1R4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HIVEP3Q5T1R4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIVEP3Q5T1R4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HIVEP3Q5T1R4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIVEP3Q5T1R4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIVEP3Q5T1R4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HIVEP3Q5T1R4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIVEP3Q5T1R4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIVEP3Q5T1R4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIVEP3Q5T1R4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIVEP3Q5T1R4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIVEP3Q5T1R4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIVEP3Q5T1R4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIVEP3Q5T1R4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIVEP3Q5T1R4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIVEP3Q5T1R4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIVEP3Q5T1R4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIVEP3Q5T1R4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIVEP3Q5T1R4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIVEP3Q5T1R4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIVEP3Q5T1R4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIVEP3Q5T1R4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIVEP3Q5T1R4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIVEP3Q5T1R4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIVEP3Q5T1R4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIVEP3Q5T1R4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIVEP3Q5T1R4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIVEP3Q5T1R4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIVEP3Q5T1R4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIVEP3Q5T1R4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIVEP3Q5T1R4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIVEP3Q5T1R4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HIVEP3Q5T1R4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HIVEP3Q5T1R4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIVEP3Q5T1R4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIVEP3Q5T1R4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HIVEP3Q5T1R4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIVEP3Q5T1R4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIVEP3Q5T1R4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIVEP3Q5T1R4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIVEP3Q5T1R4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HIVEP3Q5T1R4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIVEP3Q5T1R4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIVEP3Q5T1R4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIVEP3Q5T1R4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIVEP3Q5T1R4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIVEP3Q5T1R4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HIVEP3Q5T1R4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIVEP3Q5T1R4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIVEP3Q5T1R4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIVEP3Q5T1R4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIVEP3Q5T1R4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIVEP3Q5T1R4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HIVEP3Q5T1R4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIVEP3Q5T1R4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIVEP3Q5T1R4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIVEP3Q5T1R4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIVEP3Q5T1R4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIVEP3Q5T1R4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIVEP3Q5T1R4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIVEP3Q5T1R4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIVEP3Q5T1R4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIVEP3Q5T1R4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIVEP3Q5T1R4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HIVEP3Q5T1R4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HIVEP3Q5T1R4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms