Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TDRD12Q587J7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TDRD12Q587J7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TDRD12Q587J7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TDRD12Q587J7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TDRD12Q587J7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TDRD12Q587J7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TDRD12Q587J7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TDRD12Q587J7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TDRD12Q587J7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TDRD12Q587J7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TDRD12Q587J7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TDRD12Q587J7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TDRD12Q587J7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TDRD12Q587J7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TDRD12Q587J7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TDRD12Q587J7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TDRD12Q587J7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TDRD12Q587J7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TDRD12Q587J7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TDRD12Q587J7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TDRD12Q587J7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TDRD12Q587J7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TDRD12Q587J7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TDRD12Q587J7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TDRD12Q587J7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TDRD12Q587J7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TDRD12Q587J7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TDRD12Q587J7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TDRD12Q587J7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TDRD12Q587J7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TDRD12Q587J7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TDRD12Q587J7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TDRD12Q587J7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TDRD12Q587J7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TDRD12Q587J7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TDRD12Q587J7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TDRD12Q587J7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TDRD12Q587J7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TDRD12Q587J7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TDRD12Q587J7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TDRD12Q587J7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TDRD12Q587J7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TDRD12Q587J7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TDRD12Q587J7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TDRD12Q587J7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TDRD12Q587J7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TDRD12Q587J7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TDRD12Q587J7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TDRD12Q587J7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TDRD12Q587J7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TDRD12Q587J7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TDRD12Q587J7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TDRD12Q587J7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TDRD12Q587J7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TDRD12Q587J7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TDRD12Q587J7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TDRD12Q587J7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TDRD12Q587J7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TDRD12Q587J7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TDRD12Q587J7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TDRD12Q587J7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TDRD12Q587J7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TDRD12Q587J7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TDRD12Q587J7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TDRD12Q587J7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TDRD12Q587J7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TDRD12Q587J7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TDRD12Q587J7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TDRD12Q587J7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TDRD12Q587J7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TDRD12Q587J7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TDRD12Q587J7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TDRD12Q587J7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TDRD12Q587J7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TDRD12Q587J7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TDRD12Q587J7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TDRD12Q587J7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TDRD12Q587J7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TDRD12Q587J7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TDRD12Q587J7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TDRD12Q587J7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TDRD12Q587J7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TDRD12Q587J7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TDRD12Q587J7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TDRD12Q587J7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TDRD12Q587J7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TDRD12Q587J7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TDRD12Q587J7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TDRD12Q587J7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TDRD12Q587J7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TDRD12Q587J7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TDRD12Q587J7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TDRD12Q587J7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TDRD12Q587J7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TDRD12Q587J7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TDRD12Q587J7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TDRD12Q587J7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TDRD12Q587J7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TDRD12Q587J7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms