Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSX2Q16385 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSX2Q16385 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSX2Q16385 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSX2Q16385 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SSX2Q16385 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
SSX2Q16385 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SSX2Q16385 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SSX2Q16385 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SSX2Q16385 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SSX2Q16385 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SSX2Q16385 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SSX2Q16385 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SSX2Q16385 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SSX2Q16385 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SSX2Q16385 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SSX2Q16385 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SSX2Q16385 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SSX2Q16385 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SSX2Q16385 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SSX2Q16385 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SSX2Q16385 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SSX2Q16385 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SSX2Q16385 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SSX2Q16385 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SSX2Q16385 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SSX2Q16385 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SSX2Q16385 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SSX2Q16385 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SSX2Q16385 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SSX2Q16385 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SSX2Q16385 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SSX2Q16385 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SSX2Q16385 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SSX2Q16385 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SSX2Q16385 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SSX2Q16385 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SSX2Q16385 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SSX2Q16385 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SSX2Q16385 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SSX2Q16385 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SSX2Q16385 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SSX2Q16385 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SSX2Q16385 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SSX2Q16385 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SSX2Q16385 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SSX2Q16385 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SSX2Q16385 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SSX2Q16385 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SSX2Q16385 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SSX2Q16385 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SSX2Q16385 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SSX2Q16385 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SSX2Q16385 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SSX2Q16385 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SSX2Q16385 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SSX2Q16385 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SSX2Q16385 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSX2Q16385 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SSX2Q16385 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSX2Q16385 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSX2Q16385 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SSX2Q16385 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSX2Q16385 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSX2Q16385 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSX2Q16385 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSX2Q16385 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSX2Q16385 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSX2Q16385 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSX2Q16385 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSX2Q16385 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSX2Q16385 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSX2Q16385 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSX2Q16385 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSX2Q16385 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SSX2Q16385 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SSX2Q16385 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SSX2Q16385 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SSX2Q16385 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SSX2Q16385 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SSX2Q16385 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SSX2Q16385 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SSX2Q16385 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SSX2Q16385 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SSX2Q16385 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SSX2Q16385 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SSX2Q16385 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SSX2Q16385 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SSX2Q16385 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SSX2Q16385 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SSX2Q16385 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SSX2Q16385 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SSX2Q16385 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SSX2Q16385 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SSX2Q16385 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSX2Q16385 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSX2Q16385 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSX2Q16385 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSX2Q16385 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSX2Q16385 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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