Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEDD8Q15843 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEDD8Q15843 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEDD8Q15843 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEDD8Q15843 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEDD8Q15843 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEDD8Q15843 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEDD8Q15843 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEDD8Q15843 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEDD8Q15843 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD8Q15843 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD8Q15843 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD8Q15843 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD8Q15843 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD8Q15843 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD8Q15843 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD8Q15843 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD8Q15843 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD8Q15843 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD8Q15843 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD8Q15843 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD8Q15843 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD8Q15843 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEDD8Q15843 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEDD8Q15843 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEDD8Q15843 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEDD8Q15843 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEDD8Q15843 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEDD8Q15843 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD8Q15843 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD8Q15843 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD8Q15843 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD8Q15843 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD8Q15843 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD8Q15843 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD8Q15843 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD8Q15843 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD8Q15843 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD8Q15843 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEDD8Q15843 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD8Q15843 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD8Q15843 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD8Q15843 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD8Q15843 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD8Q15843 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEDD8Q15843 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEDD8Q15843 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEDD8Q15843 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD8Q15843 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD8Q15843 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD8Q15843 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD8Q15843 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NEDD8Q15843 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NEDD8Q15843 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD8Q15843 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD8Q15843 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD8Q15843 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD8Q15843 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD8Q15843 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NEDD8Q15843 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEDD8Q15843 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEDD8Q15843 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEDD8Q15843 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEDD8Q15843 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEDD8Q15843 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEDD8Q15843 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEDD8Q15843 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEDD8Q15843 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEDD8Q15843 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEDD8Q15843 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEDD8Q15843 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEDD8Q15843 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEDD8Q15843 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NEDD8Q15843 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEDD8Q15843 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEDD8Q15843 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NEDD8Q15843 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEDD8Q15843 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NEDD8Q15843 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEDD8Q15843 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEDD8Q15843 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEDD8Q15843 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEDD8Q15843 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEDD8Q15843 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEDD8Q15843 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NEDD8Q15843 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEDD8Q15843 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NEDD8Q15843 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NEDD8Q15843 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEDD8Q15843 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEDD8Q15843 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEDD8Q15843 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEDD8Q15843 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEDD8Q15843 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEDD8Q15843 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEDD8Q15843 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEDD8Q15843 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEDD8Q15843 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEDD8Q15843 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEDD8Q15843 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms