Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMAD1Q15797 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMAD1Q15797 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMAD1Q15797 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMAD1Q15797 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMAD1Q15797 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMAD1Q15797 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMAD1Q15797 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMAD1Q15797 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SMAD1Q15797 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMAD1Q15797 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SMAD1Q15797 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SMAD1Q15797 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SMAD1Q15797 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SMAD1Q15797 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SMAD1Q15797 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SMAD1Q15797 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SMAD1Q15797 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SMAD1Q15797 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMAD1Q15797 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SMAD1Q15797 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMAD1Q15797 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMAD1Q15797 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMAD1Q15797 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMAD1Q15797 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMAD1Q15797 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMAD1Q15797 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMAD1Q15797 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMAD1Q15797 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMAD1Q15797 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMAD1Q15797 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMAD1Q15797 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMAD1Q15797 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMAD1Q15797 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMAD1Q15797 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMAD1Q15797 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMAD1Q15797 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMAD1Q15797 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMAD1Q15797 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SMAD1Q15797 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMAD1Q15797 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SMAD1Q15797 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMAD1Q15797 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMAD1Q15797 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMAD1Q15797 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMAD1Q15797 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMAD1Q15797 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMAD1Q15797 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMAD1Q15797 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMAD1Q15797 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMAD1Q15797 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMAD1Q15797 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMAD1Q15797 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMAD1Q15797 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMAD1Q15797 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMAD1Q15797 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMAD1Q15797 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMAD1Q15797 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMAD1Q15797 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMAD1Q15797 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMAD1Q15797 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SMAD1Q15797 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMAD1Q15797 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMAD1Q15797 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMAD1Q15797 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMAD1Q15797 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMAD1Q15797 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMAD1Q15797 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMAD1Q15797 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMAD1Q15797 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMAD1Q15797 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMAD1Q15797 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMAD1Q15797 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMAD1Q15797 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMAD1Q15797 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SMAD1Q15797 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMAD1Q15797 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMAD1Q15797 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMAD1Q15797 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMAD1Q15797 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMAD1Q15797 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SMAD1Q15797 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMAD1Q15797 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMAD1Q15797 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMAD1Q15797 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMAD1Q15797 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMAD1Q15797 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMAD1Q15797 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMAD1Q15797 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMAD1Q15797 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMAD1Q15797 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMAD1Q15797 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SMAD1Q15797 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMAD1Q15797 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMAD1Q15797 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMAD1Q15797 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMAD1Q15797 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMAD1Q15797 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMAD1Q15797 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SMAD1Q15797 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
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