Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

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Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RYR3Q15413 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RYR3Q15413 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RYR3Q15413 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RYR3Q15413 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RYR3Q15413 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RYR3Q15413 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RYR3Q15413 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RYR3Q15413 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RYR3Q15413 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RYR3Q15413 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RYR3Q15413 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RYR3Q15413 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RYR3Q15413 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RYR3Q15413 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RYR3Q15413 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RYR3Q15413 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RYR3Q15413 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RYR3Q15413 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RYR3Q15413 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RYR3Q15413 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RYR3Q15413 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RYR3Q15413 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RYR3Q15413 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RYR3Q15413 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RYR3Q15413 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RYR3Q15413 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RYR3Q15413 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RYR3Q15413 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RYR3Q15413 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RYR3Q15413 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RYR3Q15413 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RYR3Q15413 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RYR3Q15413 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RYR3Q15413 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RYR3Q15413 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RYR3Q15413 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RYR3Q15413 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RYR3Q15413 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RYR3Q15413 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RYR3Q15413 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
RYR3Q15413 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RYR3Q15413 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RYR3Q15413 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RYR3Q15413 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RYR3Q15413 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RYR3Q15413 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RYR3Q15413 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RYR3Q15413 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RYR3Q15413 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RYR3Q15413 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RYR3Q15413 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RYR3Q15413 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RYR3Q15413 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RYR3Q15413 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RYR3Q15413 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RYR3Q15413 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RYR3Q15413 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RYR3Q15413 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RYR3Q15413 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RYR3Q15413 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RYR3Q15413 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RYR3Q15413 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RYR3Q15413 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RYR3Q15413 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RYR3Q15413 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RYR3Q15413 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RYR3Q15413 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RYR3Q15413 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RYR3Q15413 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RYR3Q15413 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RYR3Q15413 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RYR3Q15413 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RYR3Q15413 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RYR3Q15413 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RYR3Q15413 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RYR3Q15413 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RYR3Q15413 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RYR3Q15413 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RYR3Q15413 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RYR3Q15413 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RYR3Q15413 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RYR3Q15413 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RYR3Q15413 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RYR3Q15413 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RYR3Q15413 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RYR3Q15413 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RYR3Q15413 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RYR3Q15413 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RYR3Q15413 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RYR3Q15413 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RYR3Q15413 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RYR3Q15413 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RYR3Q15413 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RYR3Q15413 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RYR3Q15413 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RYR3Q15413 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RYR3Q15413 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RYR3Q15413 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RYR3Q15413 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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