Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PDK3Q15120 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PDK3Q15120 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDK3Q15120 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDK3Q15120 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDK3Q15120 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDK3Q15120 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDK3Q15120 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDK3Q15120 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDK3Q15120 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PDK3Q15120 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDK3Q15120 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDK3Q15120 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDK3Q15120 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDK3Q15120 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDK3Q15120 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDK3Q15120 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDK3Q15120 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDK3Q15120 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDK3Q15120 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDK3Q15120 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDK3Q15120 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDK3Q15120 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDK3Q15120 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDK3Q15120 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDK3Q15120 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDK3Q15120 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PDK3Q15120 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDK3Q15120 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDK3Q15120 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDK3Q15120 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDK3Q15120 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDK3Q15120 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PDK3Q15120 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDK3Q15120 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDK3Q15120 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDK3Q15120 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDK3Q15120 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PDK3Q15120 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDK3Q15120 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDK3Q15120 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDK3Q15120 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDK3Q15120 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDK3Q15120 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDK3Q15120 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDK3Q15120 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDK3Q15120 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDK3Q15120 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDK3Q15120 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDK3Q15120 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDK3Q15120 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDK3Q15120 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDK3Q15120 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDK3Q15120 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDK3Q15120 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDK3Q15120 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDK3Q15120 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDK3Q15120 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDK3Q15120 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDK3Q15120 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDK3Q15120 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDK3Q15120 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDK3Q15120 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDK3Q15120 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDK3Q15120 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDK3Q15120 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDK3Q15120 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDK3Q15120 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDK3Q15120 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDK3Q15120 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDK3Q15120 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDK3Q15120 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDK3Q15120 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDK3Q15120 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDK3Q15120 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PDK3Q15120 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PDK3Q15120 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDK3Q15120 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDK3Q15120 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDK3Q15120 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDK3Q15120 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDK3Q15120 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDK3Q15120 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDK3Q15120 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDK3Q15120 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDK3Q15120 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDK3Q15120 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDK3Q15120 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDK3Q15120 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDK3Q15120 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDK3Q15120 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDK3Q15120 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDK3Q15120 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDK3Q15120 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDK3Q15120 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDK3Q15120 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDK3Q15120 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDK3Q15120 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDK3Q15120 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDK3Q15120 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
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