Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMCO1Q147U7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMCO1Q147U7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMCO1Q147U7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SMCO1Q147U7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMCO1Q147U7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMCO1Q147U7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMCO1Q147U7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SMCO1Q147U7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMCO1Q147U7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMCO1Q147U7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMCO1Q147U7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMCO1Q147U7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMCO1Q147U7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMCO1Q147U7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SMCO1Q147U7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMCO1Q147U7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SMCO1Q147U7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMCO1Q147U7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMCO1Q147U7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMCO1Q147U7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMCO1Q147U7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SMCO1Q147U7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMCO1Q147U7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SMCO1Q147U7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMCO1Q147U7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMCO1Q147U7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMCO1Q147U7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMCO1Q147U7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMCO1Q147U7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMCO1Q147U7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMCO1Q147U7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMCO1Q147U7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMCO1Q147U7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMCO1Q147U7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMCO1Q147U7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMCO1Q147U7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMCO1Q147U7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMCO1Q147U7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMCO1Q147U7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMCO1Q147U7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMCO1Q147U7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMCO1Q147U7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMCO1Q147U7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMCO1Q147U7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMCO1Q147U7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMCO1Q147U7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMCO1Q147U7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMCO1Q147U7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMCO1Q147U7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMCO1Q147U7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMCO1Q147U7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMCO1Q147U7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMCO1Q147U7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMCO1Q147U7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMCO1Q147U7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMCO1Q147U7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMCO1Q147U7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMCO1Q147U7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMCO1Q147U7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SMCO1Q147U7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SMCO1Q147U7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SMCO1Q147U7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMCO1Q147U7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMCO1Q147U7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMCO1Q147U7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMCO1Q147U7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMCO1Q147U7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMCO1Q147U7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMCO1Q147U7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMCO1Q147U7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMCO1Q147U7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMCO1Q147U7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMCO1Q147U7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMCO1Q147U7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMCO1Q147U7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMCO1Q147U7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SMCO1Q147U7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMCO1Q147U7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMCO1Q147U7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMCO1Q147U7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMCO1Q147U7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMCO1Q147U7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMCO1Q147U7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMCO1Q147U7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMCO1Q147U7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMCO1Q147U7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SMCO1Q147U7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SMCO1Q147U7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMCO1Q147U7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMCO1Q147U7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMCO1Q147U7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMCO1Q147U7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMCO1Q147U7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SMCO1Q147U7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SMCO1Q147U7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMCO1Q147U7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMCO1Q147U7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMCO1Q147U7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMCO1Q147U7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
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