Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SREBF2Q12772 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SREBF2Q12772 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SREBF2Q12772 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SREBF2Q12772 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
SREBF2Q12772 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SREBF2Q12772 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SREBF2Q12772 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SREBF2Q12772 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SREBF2Q12772 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SREBF2Q12772 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
SREBF2Q12772 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
SREBF2Q12772 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SREBF2Q12772 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SREBF2Q12772 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SREBF2Q12772 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SREBF2Q12772 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SREBF2Q12772 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SREBF2Q12772 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SREBF2Q12772 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SREBF2Q12772 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SREBF2Q12772 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SREBF2Q12772 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SREBF2Q12772 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SREBF2Q12772 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SREBF2Q12772 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SREBF2Q12772 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SREBF2Q12772 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SREBF2Q12772 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SREBF2Q12772 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
SREBF2Q12772 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SREBF2Q12772 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SREBF2Q12772 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SREBF2Q12772 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SREBF2Q12772 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SREBF2Q12772 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SREBF2Q12772 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SREBF2Q12772 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SREBF2Q12772 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SREBF2Q12772 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SREBF2Q12772 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
SREBF2Q12772 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
SREBF2Q12772 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SREBF2Q12772 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SREBF2Q12772 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SREBF2Q12772 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SREBF2Q12772 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SREBF2Q12772 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SREBF2Q12772 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SREBF2Q12772 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SREBF2Q12772 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SREBF2Q12772 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SREBF2Q12772 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SREBF2Q12772 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SREBF2Q12772 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SREBF2Q12772 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SREBF2Q12772 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SREBF2Q12772 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SREBF2Q12772 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SREBF2Q12772 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SREBF2Q12772 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SREBF2Q12772 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SREBF2Q12772 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SREBF2Q12772 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SREBF2Q12772 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SREBF2Q12772 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SREBF2Q12772 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
SREBF2Q12772 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SREBF2Q12772 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SREBF2Q12772 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SREBF2Q12772 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SREBF2Q12772 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SREBF2Q12772 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SREBF2Q12772 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SREBF2Q12772 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SREBF2Q12772 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SREBF2Q12772 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SREBF2Q12772 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SREBF2Q12772 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SREBF2Q12772 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SREBF2Q12772 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SREBF2Q12772 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SREBF2Q12772 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SREBF2Q12772 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SREBF2Q12772 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SREBF2Q12772 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SREBF2Q12772 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SREBF2Q12772 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SREBF2Q12772 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
SREBF2Q12772 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SREBF2Q12772 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SREBF2Q12772 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SREBF2Q12772 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SREBF2Q12772 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SREBF2Q12772 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SREBF2Q12772 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SREBF2Q12772 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SREBF2Q12772 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SREBF2Q12772 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SREBF2Q12772 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
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