Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPOCK1Q08629 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPOCK1Q08629 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPOCK1Q08629 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPOCK1Q08629 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPOCK1Q08629 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPOCK1Q08629 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPOCK1Q08629 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPOCK1Q08629 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPOCK1Q08629 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPOCK1Q08629 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPOCK1Q08629 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPOCK1Q08629 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPOCK1Q08629 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPOCK1Q08629 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPOCK1Q08629 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPOCK1Q08629 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPOCK1Q08629 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPOCK1Q08629 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPOCK1Q08629 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPOCK1Q08629 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPOCK1Q08629 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPOCK1Q08629 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPOCK1Q08629 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPOCK1Q08629 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPOCK1Q08629 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPOCK1Q08629 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPOCK1Q08629 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SPOCK1Q08629 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPOCK1Q08629 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPOCK1Q08629 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPOCK1Q08629 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPOCK1Q08629 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPOCK1Q08629 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPOCK1Q08629 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPOCK1Q08629 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPOCK1Q08629 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPOCK1Q08629 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPOCK1Q08629 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPOCK1Q08629 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPOCK1Q08629 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPOCK1Q08629 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPOCK1Q08629 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPOCK1Q08629 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SPOCK1Q08629 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPOCK1Q08629 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPOCK1Q08629 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPOCK1Q08629 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPOCK1Q08629 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPOCK1Q08629 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPOCK1Q08629 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPOCK1Q08629 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPOCK1Q08629 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPOCK1Q08629 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPOCK1Q08629 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPOCK1Q08629 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPOCK1Q08629 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPOCK1Q08629 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPOCK1Q08629 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPOCK1Q08629 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SPOCK1Q08629 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPOCK1Q08629 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPOCK1Q08629 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPOCK1Q08629 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPOCK1Q08629 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPOCK1Q08629 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPOCK1Q08629 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPOCK1Q08629 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPOCK1Q08629 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPOCK1Q08629 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPOCK1Q08629 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPOCK1Q08629 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPOCK1Q08629 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPOCK1Q08629 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPOCK1Q08629 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPOCK1Q08629 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPOCK1Q08629 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPOCK1Q08629 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPOCK1Q08629 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPOCK1Q08629 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPOCK1Q08629 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPOCK1Q08629 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPOCK1Q08629 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPOCK1Q08629 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPOCK1Q08629 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPOCK1Q08629 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPOCK1Q08629 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPOCK1Q08629 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPOCK1Q08629 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPOCK1Q08629 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPOCK1Q08629 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPOCK1Q08629 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPOCK1Q08629 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SPOCK1Q08629 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPOCK1Q08629 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPOCK1Q08629 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPOCK1Q08629 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPOCK1Q08629 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPOCK1Q08629 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPOCK1Q08629 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.1 ms