Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CACNB2Q08289 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CACNB2Q08289 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CACNB2Q08289 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CACNB2Q08289 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CACNB2Q08289 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CACNB2Q08289 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CACNB2Q08289 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CACNB2Q08289 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CACNB2Q08289 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CACNB2Q08289 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CACNB2Q08289 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CACNB2Q08289 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CACNB2Q08289 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CACNB2Q08289 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CACNB2Q08289 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CACNB2Q08289 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CACNB2Q08289 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CACNB2Q08289 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CACNB2Q08289 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CACNB2Q08289 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CACNB2Q08289 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CACNB2Q08289 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CACNB2Q08289 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CACNB2Q08289 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CACNB2Q08289 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CACNB2Q08289 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CACNB2Q08289 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CACNB2Q08289 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CACNB2Q08289 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CACNB2Q08289 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CACNB2Q08289 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CACNB2Q08289 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CACNB2Q08289 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CACNB2Q08289 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CACNB2Q08289 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CACNB2Q08289 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CACNB2Q08289 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CACNB2Q08289 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CACNB2Q08289 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CACNB2Q08289 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CACNB2Q08289 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CACNB2Q08289 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CACNB2Q08289 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CACNB2Q08289 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CACNB2Q08289 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CACNB2Q08289 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CACNB2Q08289 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CACNB2Q08289 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CACNB2Q08289 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CACNB2Q08289 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CACNB2Q08289 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CACNB2Q08289 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CACNB2Q08289 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CACNB2Q08289 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CACNB2Q08289 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CACNB2Q08289 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CACNB2Q08289 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CACNB2Q08289 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CACNB2Q08289 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CACNB2Q08289 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CACNB2Q08289 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CACNB2Q08289 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CACNB2Q08289 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CACNB2Q08289 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CACNB2Q08289 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CACNB2Q08289 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CACNB2Q08289 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CACNB2Q08289 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CACNB2Q08289 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CACNB2Q08289 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CACNB2Q08289 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CACNB2Q08289 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CACNB2Q08289 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CACNB2Q08289 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CACNB2Q08289 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CACNB2Q08289 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CACNB2Q08289 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CACNB2Q08289 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CACNB2Q08289 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CACNB2Q08289 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CACNB2Q08289 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CACNB2Q08289 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CACNB2Q08289 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CACNB2Q08289 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CACNB2Q08289 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CACNB2Q08289 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CACNB2Q08289 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CACNB2Q08289 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CACNB2Q08289 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CACNB2Q08289 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CACNB2Q08289 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CACNB2Q08289 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CACNB2Q08289 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CACNB2Q08289 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CACNB2Q08289 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CACNB2Q08289 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CACNB2Q08289 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CACNB2Q08289 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CACNB2Q08289 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 194.7 ms