Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLEQ07864 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLEQ07864 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLEQ07864 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLEQ07864 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLEQ07864 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLEQ07864 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLEQ07864 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLEQ07864 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLEQ07864 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLEQ07864 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLEQ07864 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
POLEQ07864 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLEQ07864 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLEQ07864 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLEQ07864 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLEQ07864 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLEQ07864 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLEQ07864 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
POLEQ07864 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLEQ07864 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLEQ07864 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLEQ07864 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLEQ07864 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLEQ07864 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLEQ07864 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLEQ07864 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
POLEQ07864 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLEQ07864 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLEQ07864 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLEQ07864 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLEQ07864 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLEQ07864 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLEQ07864 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLEQ07864 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLEQ07864 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLEQ07864 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
POLEQ07864 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLEQ07864 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLEQ07864 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLEQ07864 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLEQ07864 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLEQ07864 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
POLEQ07864 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLEQ07864 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLEQ07864 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLEQ07864 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLEQ07864 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLEQ07864 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLEQ07864 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLEQ07864 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLEQ07864 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLEQ07864 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLEQ07864 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLEQ07864 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLEQ07864 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLEQ07864 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
POLEQ07864 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLEQ07864 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLEQ07864 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLEQ07864 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLEQ07864 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLEQ07864 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLEQ07864 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLEQ07864 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLEQ07864 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLEQ07864 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLEQ07864 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLEQ07864 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
POLEQ07864 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLEQ07864 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
POLEQ07864 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLEQ07864 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLEQ07864 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLEQ07864 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLEQ07864 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLEQ07864 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLEQ07864 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLEQ07864 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLEQ07864 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLEQ07864 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLEQ07864 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLEQ07864 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLEQ07864 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLEQ07864 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLEQ07864 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLEQ07864 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLEQ07864 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLEQ07864 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLEQ07864 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLEQ07864 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLEQ07864 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLEQ07864 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
POLEQ07864 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLEQ07864 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
POLEQ07864 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLEQ07864 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLEQ07864 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLEQ07864 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLEQ07864 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms