Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
PSME1Q06323 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PSME1Q06323 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PSME1Q06323 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
PSME1Q06323 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
PSME1Q06323 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
PSME1Q06323 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PSME1Q06323 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PSME1Q06323 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PSME1Q06323 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
PSME1Q06323 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PSME1Q06323 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
PSME1Q06323 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PSME1Q06323 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PSME1Q06323 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PSME1Q06323 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PSME1Q06323 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
PSME1Q06323 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PSME1Q06323 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PSME1Q06323 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
PSME1Q06323 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
PSME1Q06323 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
PSME1Q06323 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PSME1Q06323 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PSME1Q06323 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PSME1Q06323 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PSME1Q06323 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PSME1Q06323 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PSME1Q06323 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PSME1Q06323 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PSME1Q06323 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PSME1Q06323 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PSME1Q06323 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PSME1Q06323 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PSME1Q06323 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PSME1Q06323 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
PSME1Q06323 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
PSME1Q06323 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PSME1Q06323 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PSME1Q06323 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PSME1Q06323 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PSME1Q06323 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
PSME1Q06323 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PSME1Q06323 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PSME1Q06323 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PSME1Q06323 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PSME1Q06323 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PSME1Q06323 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PSME1Q06323 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PSME1Q06323 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PSME1Q06323 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PSME1Q06323 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PSME1Q06323 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PSME1Q06323 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PSME1Q06323 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PSME1Q06323 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PSME1Q06323 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PSME1Q06323 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
PSME1Q06323 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PSME1Q06323 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PSME1Q06323 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PSME1Q06323 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PSME1Q06323 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PSME1Q06323 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
PSME1Q06323 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PSME1Q06323 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PSME1Q06323 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PSME1Q06323 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PSME1Q06323 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PSME1Q06323 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PSME1Q06323 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PSME1Q06323 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PSME1Q06323 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PSME1Q06323 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PSME1Q06323 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PSME1Q06323 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PSME1Q06323 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PSME1Q06323 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PSME1Q06323 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PSME1Q06323 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PSME1Q06323 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PSME1Q06323 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PSME1Q06323 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PSME1Q06323 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PSME1Q06323 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PSME1Q06323 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PSME1Q06323 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PSME1Q06323 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PSME1Q06323 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PSME1Q06323 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PSME1Q06323 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PSME1Q06323 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PSME1Q06323 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PSME1Q06323 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PSME1Q06323 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
PSME1Q06323 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PSME1Q06323 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
PSME1Q06323 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
PSME1Q06323 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
PSME1Q06323 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.3 ms