Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ARID5AQ03989 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ARID5AQ03989 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ARID5AQ03989 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ARID5AQ03989 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARID5AQ03989 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARID5AQ03989 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARID5AQ03989 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARID5AQ03989 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARID5AQ03989 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARID5AQ03989 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARID5AQ03989 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARID5AQ03989 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARID5AQ03989 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARID5AQ03989 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ARID5AQ03989 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARID5AQ03989 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARID5AQ03989 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARID5AQ03989 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARID5AQ03989 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARID5AQ03989 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARID5AQ03989 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARID5AQ03989 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARID5AQ03989 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARID5AQ03989 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARID5AQ03989 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARID5AQ03989 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARID5AQ03989 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARID5AQ03989 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARID5AQ03989 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARID5AQ03989 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARID5AQ03989 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARID5AQ03989 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARID5AQ03989 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARID5AQ03989 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARID5AQ03989 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARID5AQ03989 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARID5AQ03989 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARID5AQ03989 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARID5AQ03989 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARID5AQ03989 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARID5AQ03989 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARID5AQ03989 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARID5AQ03989 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARID5AQ03989 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ARID5AQ03989 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARID5AQ03989 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARID5AQ03989 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARID5AQ03989 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARID5AQ03989 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARID5AQ03989 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARID5AQ03989 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARID5AQ03989 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARID5AQ03989 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARID5AQ03989 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARID5AQ03989 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARID5AQ03989 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARID5AQ03989 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARID5AQ03989 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARID5AQ03989 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ARID5AQ03989 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARID5AQ03989 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARID5AQ03989 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARID5AQ03989 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARID5AQ03989 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARID5AQ03989 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARID5AQ03989 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARID5AQ03989 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARID5AQ03989 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARID5AQ03989 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARID5AQ03989 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARID5AQ03989 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARID5AQ03989 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARID5AQ03989 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARID5AQ03989 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARID5AQ03989 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARID5AQ03989 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARID5AQ03989 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARID5AQ03989 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID5AQ03989 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID5AQ03989 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID5AQ03989 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARID5AQ03989 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARID5AQ03989 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ARID5AQ03989 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARID5AQ03989 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARID5AQ03989 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARID5AQ03989 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ARID5AQ03989 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ARID5AQ03989 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ARID5AQ03989 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ARID5AQ03989 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ARID5AQ03989 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ARID5AQ03989 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARID5AQ03989 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARID5AQ03989 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARID5AQ03989 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARID5AQ03989 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARID5AQ03989 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARID5AQ03989 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms