Protein–RNA interactions for Protein: Q02575

NHLH1, Helix-loop-helix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH1Q02575 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NHLH1Q02575 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NHLH1Q02575 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NHLH1Q02575 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NHLH1Q02575 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NHLH1Q02575 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NHLH1Q02575 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NHLH1Q02575 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NHLH1Q02575 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NHLH1Q02575 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NHLH1Q02575 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NHLH1Q02575 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NHLH1Q02575 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NHLH1Q02575 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NHLH1Q02575 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NHLH1Q02575 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NHLH1Q02575 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NHLH1Q02575 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NHLH1Q02575 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NHLH1Q02575 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NHLH1Q02575 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NHLH1Q02575 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NHLH1Q02575 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NHLH1Q02575 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NHLH1Q02575 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NHLH1Q02575 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NHLH1Q02575 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NHLH1Q02575 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NHLH1Q02575 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NHLH1Q02575 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NHLH1Q02575 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NHLH1Q02575 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NHLH1Q02575 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NHLH1Q02575 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NHLH1Q02575 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NHLH1Q02575 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NHLH1Q02575 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NHLH1Q02575 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NHLH1Q02575 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NHLH1Q02575 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NHLH1Q02575 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NHLH1Q02575 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NHLH1Q02575 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NHLH1Q02575 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NHLH1Q02575 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NHLH1Q02575 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NHLH1Q02575 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NHLH1Q02575 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NHLH1Q02575 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NHLH1Q02575 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NHLH1Q02575 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NHLH1Q02575 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NHLH1Q02575 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NHLH1Q02575 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NHLH1Q02575 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NHLH1Q02575 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NHLH1Q02575 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NHLH1Q02575 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NHLH1Q02575 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NHLH1Q02575 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NHLH1Q02575 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NHLH1Q02575 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NHLH1Q02575 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NHLH1Q02575 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NHLH1Q02575 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NHLH1Q02575 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NHLH1Q02575 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NHLH1Q02575 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NHLH1Q02575 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NHLH1Q02575 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NHLH1Q02575 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NHLH1Q02575 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NHLH1Q02575 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NHLH1Q02575 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NHLH1Q02575 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NHLH1Q02575 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NHLH1Q02575 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NHLH1Q02575 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NHLH1Q02575 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NHLH1Q02575 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NHLH1Q02575 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NHLH1Q02575 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NHLH1Q02575 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NHLH1Q02575 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NHLH1Q02575 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NHLH1Q02575 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NHLH1Q02575 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NHLH1Q02575 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NHLH1Q02575 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NHLH1Q02575 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NHLH1Q02575 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NHLH1Q02575 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NHLH1Q02575 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NHLH1Q02575 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NHLH1Q02575 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NHLH1Q02575 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NHLH1Q02575 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NHLH1Q02575 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NHLH1Q02575 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NHLH1Q02575 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.9 ms