Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDR2Q01850 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDR2Q01850 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDR2Q01850 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDR2Q01850 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDR2Q01850 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDR2Q01850 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDR2Q01850 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDR2Q01850 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDR2Q01850 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDR2Q01850 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDR2Q01850 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDR2Q01850 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDR2Q01850 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDR2Q01850 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDR2Q01850 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDR2Q01850 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDR2Q01850 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDR2Q01850 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDR2Q01850 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDR2Q01850 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDR2Q01850 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDR2Q01850 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDR2Q01850 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDR2Q01850 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDR2Q01850 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDR2Q01850 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDR2Q01850 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDR2Q01850 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDR2Q01850 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDR2Q01850 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDR2Q01850 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CDR2Q01850 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CDR2Q01850 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDR2Q01850 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDR2Q01850 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDR2Q01850 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDR2Q01850 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDR2Q01850 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDR2Q01850 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDR2Q01850 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDR2Q01850 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDR2Q01850 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDR2Q01850 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDR2Q01850 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDR2Q01850 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDR2Q01850 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDR2Q01850 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDR2Q01850 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDR2Q01850 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDR2Q01850 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDR2Q01850 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDR2Q01850 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDR2Q01850 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDR2Q01850 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDR2Q01850 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDR2Q01850 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDR2Q01850 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDR2Q01850 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDR2Q01850 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDR2Q01850 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDR2Q01850 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDR2Q01850 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDR2Q01850 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDR2Q01850 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDR2Q01850 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDR2Q01850 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDR2Q01850 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDR2Q01850 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDR2Q01850 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDR2Q01850 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDR2Q01850 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDR2Q01850 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDR2Q01850 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CDR2Q01850 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CDR2Q01850 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CDR2Q01850 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CDR2Q01850 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CDR2Q01850 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CDR2Q01850 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CDR2Q01850 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CDR2Q01850 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CDR2Q01850 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDR2Q01850 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDR2Q01850 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDR2Q01850 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDR2Q01850 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDR2Q01850 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDR2Q01850 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CDR2Q01850 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDR2Q01850 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDR2Q01850 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CDR2Q01850 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDR2Q01850 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CDR2Q01850 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CDR2Q01850 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CDR2Q01850 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDR2Q01850 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDR2Q01850 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDR2Q01850 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms