Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKP1P63208 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKP1P63208 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKP1P63208 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SKP1P63208 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKP1P63208 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SKP1P63208 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SKP1P63208 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SKP1P63208 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SKP1P63208 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SKP1P63208 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SKP1P63208 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SKP1P63208 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SKP1P63208 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SKP1P63208 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SKP1P63208 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SKP1P63208 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKP1P63208 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKP1P63208 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SKP1P63208 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKP1P63208 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKP1P63208 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SKP1P63208 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKP1P63208 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKP1P63208 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKP1P63208 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKP1P63208 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKP1P63208 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKP1P63208 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKP1P63208 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKP1P63208 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKP1P63208 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKP1P63208 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKP1P63208 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKP1P63208 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SKP1P63208 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SKP1P63208 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SKP1P63208 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKP1P63208 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKP1P63208 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKP1P63208 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKP1P63208 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKP1P63208 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SKP1P63208 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKP1P63208 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SKP1P63208 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKP1P63208 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKP1P63208 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKP1P63208 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKP1P63208 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKP1P63208 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SKP1P63208 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKP1P63208 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKP1P63208 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SKP1P63208 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKP1P63208 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SKP1P63208 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKP1P63208 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKP1P63208 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKP1P63208 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SKP1P63208 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKP1P63208 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKP1P63208 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKP1P63208 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SKP1P63208 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SKP1P63208 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKP1P63208 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKP1P63208 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKP1P63208 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SKP1P63208 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKP1P63208 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKP1P63208 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKP1P63208 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKP1P63208 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SKP1P63208 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKP1P63208 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKP1P63208 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKP1P63208 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKP1P63208 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SKP1P63208 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKP1P63208 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKP1P63208 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SKP1P63208 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKP1P63208 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKP1P63208 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SKP1P63208 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKP1P63208 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKP1P63208 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKP1P63208 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKP1P63208 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKP1P63208 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKP1P63208 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SKP1P63208 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKP1P63208 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKP1P63208 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SKP1P63208 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKP1P63208 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SKP1P63208 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SKP1P63208 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SKP1P63208 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms