Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPD2P62316 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPD2P62316 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPD2P62316 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPD2P62316 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPD2P62316 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPD2P62316 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPD2P62316 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPD2P62316 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPD2P62316 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPD2P62316 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPD2P62316 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPD2P62316 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPD2P62316 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPD2P62316 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRPD2P62316 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRPD2P62316 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPD2P62316 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPD2P62316 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPD2P62316 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPD2P62316 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPD2P62316 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPD2P62316 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPD2P62316 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPD2P62316 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPD2P62316 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPD2P62316 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPD2P62316 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPD2P62316 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPD2P62316 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPD2P62316 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPD2P62316 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRPD2P62316 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRPD2P62316 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRPD2P62316 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRPD2P62316 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRPD2P62316 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRPD2P62316 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRPD2P62316 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRPD2P62316 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRPD2P62316 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRPD2P62316 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRPD2P62316 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRPD2P62316 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRPD2P62316 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRPD2P62316 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRPD2P62316 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRPD2P62316 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRPD2P62316 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRPD2P62316 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRPD2P62316 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRPD2P62316 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRPD2P62316 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRPD2P62316 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRPD2P62316 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRPD2P62316 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRPD2P62316 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRPD2P62316 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRPD2P62316 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRPD2P62316 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRPD2P62316 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRPD2P62316 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPD2P62316 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPD2P62316 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPD2P62316 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPD2P62316 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPD2P62316 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPD2P62316 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPD2P62316 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRPD2P62316 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRPD2P62316 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRPD2P62316 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRPD2P62316 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRPD2P62316 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPD2P62316 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPD2P62316 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPD2P62316 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPD2P62316 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPD2P62316 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPD2P62316 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPD2P62316 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPD2P62316 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPD2P62316 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPD2P62316 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPD2P62316 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRPD2P62316 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRPD2P62316 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRPD2P62316 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRPD2P62316 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRPD2P62316 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRPD2P62316 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRPD2P62316 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRPD2P62316 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRPD2P62316 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRPD2P62316 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRPD2P62316 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRPD2P62316 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRPD2P62316 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRPD2P62316 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRPD2P62316 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms