Protein–RNA interactions for Protein: P61158

ACTR3, Actin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3P61158 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACTR3P61158 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTR3P61158 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACTR3P61158 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTR3P61158 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTR3P61158 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTR3P61158 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTR3P61158 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTR3P61158 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTR3P61158 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTR3P61158 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTR3P61158 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACTR3P61158 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTR3P61158 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTR3P61158 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTR3P61158 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTR3P61158 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACTR3P61158 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTR3P61158 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTR3P61158 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTR3P61158 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTR3P61158 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACTR3P61158 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ACTR3P61158 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ACTR3P61158 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ACTR3P61158 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTR3P61158 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTR3P61158 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTR3P61158 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTR3P61158 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACTR3P61158 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTR3P61158 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTR3P61158 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTR3P61158 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTR3P61158 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACTR3P61158 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTR3P61158 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTR3P61158 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACTR3P61158 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTR3P61158 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTR3P61158 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTR3P61158 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTR3P61158 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTR3P61158 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTR3P61158 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTR3P61158 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACTR3P61158 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
ACTR3P61158 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACTR3P61158 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTR3P61158 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACTR3P61158 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTR3P61158 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTR3P61158 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTR3P61158 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTR3P61158 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTR3P61158 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTR3P61158 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTR3P61158 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTR3P61158 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTR3P61158 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTR3P61158 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTR3P61158 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTR3P61158 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTR3P61158 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTR3P61158 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTR3P61158 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTR3P61158 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTR3P61158 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTR3P61158 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTR3P61158 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACTR3P61158 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACTR3P61158 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACTR3P61158 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACTR3P61158 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACTR3P61158 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACTR3P61158 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTR3P61158 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTR3P61158 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTR3P61158 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTR3P61158 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTR3P61158 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTR3P61158 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTR3P61158 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTR3P61158 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTR3P61158 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTR3P61158 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTR3P61158 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTR3P61158 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTR3P61158 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTR3P61158 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTR3P61158 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTR3P61158 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTR3P61158 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTR3P61158 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTR3P61158 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTR3P61158 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTR3P61158 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTR3P61158 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTR3P61158 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTR3P61158 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms