Protein–RNA interactions for Protein: P60891

PRPS1, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPS1P60891 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPS1P60891 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPS1P60891 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPS1P60891 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPS1P60891 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPS1P60891 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPS1P60891 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPS1P60891 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPS1P60891 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPS1P60891 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPS1P60891 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPS1P60891 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPS1P60891 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPS1P60891 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPS1P60891 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPS1P60891 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPS1P60891 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPS1P60891 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPS1P60891 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPS1P60891 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPS1P60891 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPS1P60891 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPS1P60891 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRPS1P60891 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPS1P60891 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPS1P60891 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPS1P60891 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPS1P60891 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPS1P60891 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRPS1P60891 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPS1P60891 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPS1P60891 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPS1P60891 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRPS1P60891 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPS1P60891 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPS1P60891 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPS1P60891 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRPS1P60891 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRPS1P60891 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPS1P60891 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPS1P60891 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPS1P60891 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRPS1P60891 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRPS1P60891 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPS1P60891 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPS1P60891 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRPS1P60891 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPS1P60891 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPS1P60891 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPS1P60891 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPS1P60891 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPS1P60891 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRPS1P60891 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPS1P60891 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPS1P60891 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPS1P60891 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPS1P60891 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPS1P60891 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRPS1P60891 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPS1P60891 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRPS1P60891 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRPS1P60891 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRPS1P60891 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPS1P60891 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPS1P60891 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRPS1P60891 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPS1P60891 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPS1P60891 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRPS1P60891 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPS1P60891 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRPS1P60891 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPS1P60891 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPS1P60891 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPS1P60891 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPS1P60891 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRPS1P60891 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPS1P60891 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPS1P60891 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPS1P60891 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPS1P60891 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPS1P60891 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPS1P60891 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPS1P60891 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPS1P60891 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPS1P60891 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPS1P60891 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPS1P60891 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPS1P60891 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPS1P60891 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPS1P60891 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPS1P60891 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRPS1P60891 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRPS1P60891 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRPS1P60891 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPS1P60891 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPS1P60891 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPS1P60891 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPS1P60891 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPS1P60891 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPS1P60891 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms