Protein–RNA interactions for Protein: P59998

ARPC4, Actin-related protein 2/3 complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC4P59998 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARPC4P59998 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARPC4P59998 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARPC4P59998 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARPC4P59998 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARPC4P59998 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARPC4P59998 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARPC4P59998 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ARPC4P59998 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ARPC4P59998 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARPC4P59998 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARPC4P59998 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARPC4P59998 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARPC4P59998 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARPC4P59998 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARPC4P59998 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARPC4P59998 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARPC4P59998 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARPC4P59998 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARPC4P59998 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARPC4P59998 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARPC4P59998 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARPC4P59998 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARPC4P59998 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARPC4P59998 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ARPC4P59998 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARPC4P59998 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARPC4P59998 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARPC4P59998 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARPC4P59998 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARPC4P59998 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARPC4P59998 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARPC4P59998 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARPC4P59998 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARPC4P59998 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARPC4P59998 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARPC4P59998 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARPC4P59998 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARPC4P59998 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARPC4P59998 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARPC4P59998 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARPC4P59998 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARPC4P59998 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARPC4P59998 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARPC4P59998 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARPC4P59998 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARPC4P59998 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARPC4P59998 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARPC4P59998 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARPC4P59998 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARPC4P59998 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARPC4P59998 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARPC4P59998 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARPC4P59998 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARPC4P59998 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARPC4P59998 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARPC4P59998 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARPC4P59998 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARPC4P59998 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARPC4P59998 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARPC4P59998 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARPC4P59998 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARPC4P59998 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARPC4P59998 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARPC4P59998 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARPC4P59998 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARPC4P59998 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARPC4P59998 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARPC4P59998 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARPC4P59998 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARPC4P59998 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARPC4P59998 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARPC4P59998 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ARPC4P59998 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARPC4P59998 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ARPC4P59998 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARPC4P59998 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARPC4P59998 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARPC4P59998 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARPC4P59998 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARPC4P59998 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARPC4P59998 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARPC4P59998 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARPC4P59998 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARPC4P59998 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARPC4P59998 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARPC4P59998 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ARPC4P59998 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARPC4P59998 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARPC4P59998 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARPC4P59998 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARPC4P59998 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARPC4P59998 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARPC4P59998 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARPC4P59998 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARPC4P59998 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARPC4P59998 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARPC4P59998 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARPC4P59998 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARPC4P59998 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms