Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP107P57740 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP107P57740 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP107P57740 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP107P57740 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP107P57740 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP107P57740 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP107P57740 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP107P57740 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP107P57740 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP107P57740 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP107P57740 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP107P57740 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP107P57740 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP107P57740 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP107P57740 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP107P57740 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP107P57740 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP107P57740 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP107P57740 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP107P57740 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NUP107P57740 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NUP107P57740 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUP107P57740 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP107P57740 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP107P57740 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP107P57740 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP107P57740 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP107P57740 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP107P57740 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP107P57740 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUP107P57740 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP107P57740 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP107P57740 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP107P57740 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP107P57740 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP107P57740 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP107P57740 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP107P57740 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP107P57740 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP107P57740 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP107P57740 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP107P57740 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP107P57740 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP107P57740 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP107P57740 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP107P57740 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP107P57740 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP107P57740 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP107P57740 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP107P57740 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP107P57740 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP107P57740 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUP107P57740 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUP107P57740 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUP107P57740 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUP107P57740 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUP107P57740 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUP107P57740 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUP107P57740 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP107P57740 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP107P57740 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP107P57740 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP107P57740 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP107P57740 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP107P57740 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP107P57740 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP107P57740 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP107P57740 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP107P57740 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP107P57740 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP107P57740 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP107P57740 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP107P57740 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP107P57740 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP107P57740 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP107P57740 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP107P57740 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP107P57740 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP107P57740 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP107P57740 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP107P57740 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP107P57740 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP107P57740 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP107P57740 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP107P57740 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP107P57740 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP107P57740 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP107P57740 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP107P57740 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP107P57740 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP107P57740 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP107P57740 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP107P57740 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP107P57740 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP107P57740 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP107P57740 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP107P57740 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP107P57740 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP107P57740 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms