Protein–RNA interactions for Protein: P56278

MTCP1, Protein p13 MTCP-1, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCP1P56278 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTCP1P56278 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTCP1P56278 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MTCP1P56278 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTCP1P56278 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTCP1P56278 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTCP1P56278 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTCP1P56278 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MTCP1P56278 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTCP1P56278 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTCP1P56278 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTCP1P56278 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTCP1P56278 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTCP1P56278 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTCP1P56278 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MTCP1P56278 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTCP1P56278 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTCP1P56278 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTCP1P56278 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTCP1P56278 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTCP1P56278 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MTCP1P56278 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTCP1P56278 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTCP1P56278 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTCP1P56278 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTCP1P56278 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MTCP1P56278 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTCP1P56278 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTCP1P56278 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTCP1P56278 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MTCP1P56278 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MTCP1P56278 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTCP1P56278 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTCP1P56278 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTCP1P56278 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTCP1P56278 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTCP1P56278 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MTCP1P56278 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTCP1P56278 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTCP1P56278 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTCP1P56278 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTCP1P56278 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTCP1P56278 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTCP1P56278 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTCP1P56278 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTCP1P56278 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTCP1P56278 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTCP1P56278 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTCP1P56278 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTCP1P56278 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTCP1P56278 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTCP1P56278 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTCP1P56278 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTCP1P56278 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTCP1P56278 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTCP1P56278 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTCP1P56278 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTCP1P56278 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTCP1P56278 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTCP1P56278 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTCP1P56278 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTCP1P56278 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTCP1P56278 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTCP1P56278 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTCP1P56278 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTCP1P56278 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTCP1P56278 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MTCP1P56278 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTCP1P56278 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTCP1P56278 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTCP1P56278 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTCP1P56278 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MTCP1P56278 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTCP1P56278 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTCP1P56278 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MTCP1P56278 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTCP1P56278 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTCP1P56278 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTCP1P56278 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTCP1P56278 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTCP1P56278 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTCP1P56278 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTCP1P56278 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTCP1P56278 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTCP1P56278 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTCP1P56278 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MTCP1P56278 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MTCP1P56278 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTCP1P56278 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTCP1P56278 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTCP1P56278 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTCP1P56278 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MTCP1P56278 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTCP1P56278 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTCP1P56278 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTCP1P56278 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTCP1P56278 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTCP1P56278 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MTCP1P56278 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MTCP1P56278 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms