Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HLCSP50747 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HLCSP50747 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HLCSP50747 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HLCSP50747 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HLCSP50747 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HLCSP50747 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HLCSP50747 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HLCSP50747 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLCSP50747 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLCSP50747 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLCSP50747 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLCSP50747 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLCSP50747 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLCSP50747 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLCSP50747 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLCSP50747 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLCSP50747 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLCSP50747 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLCSP50747 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLCSP50747 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HLCSP50747 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLCSP50747 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLCSP50747 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HLCSP50747 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HLCSP50747 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HLCSP50747 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HLCSP50747 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HLCSP50747 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HLCSP50747 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HLCSP50747 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HLCSP50747 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HLCSP50747 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HLCSP50747 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HLCSP50747 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HLCSP50747 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HLCSP50747 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HLCSP50747 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HLCSP50747 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HLCSP50747 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HLCSP50747 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HLCSP50747 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HLCSP50747 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HLCSP50747 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HLCSP50747 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HLCSP50747 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HLCSP50747 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HLCSP50747 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HLCSP50747 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HLCSP50747 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HLCSP50747 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HLCSP50747 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HLCSP50747 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HLCSP50747 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HLCSP50747 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HLCSP50747 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HLCSP50747 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HLCSP50747 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HLCSP50747 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HLCSP50747 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HLCSP50747 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HLCSP50747 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HLCSP50747 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HLCSP50747 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HLCSP50747 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HLCSP50747 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HLCSP50747 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HLCSP50747 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HLCSP50747 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HLCSP50747 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HLCSP50747 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HLCSP50747 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HLCSP50747 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HLCSP50747 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HLCSP50747 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HLCSP50747 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HLCSP50747 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HLCSP50747 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HLCSP50747 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HLCSP50747 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HLCSP50747 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HLCSP50747 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HLCSP50747 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HLCSP50747 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HLCSP50747 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HLCSP50747 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HLCSP50747 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HLCSP50747 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HLCSP50747 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HLCSP50747 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HLCSP50747 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLCSP50747 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLCSP50747 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLCSP50747 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLCSP50747 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLCSP50747 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HLCSP50747 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HLCSP50747 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HLCSP50747 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HLCSP50747 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms