Protein–RNA interactions for Protein: P48764

SLC9A3, Sodium/hydrogen exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3P48764 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC9A3P48764 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC9A3P48764 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC9A3P48764 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC9A3P48764 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC9A3P48764 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC9A3P48764 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC9A3P48764 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC9A3P48764 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC9A3P48764 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC9A3P48764 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC9A3P48764 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC9A3P48764 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC9A3P48764 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC9A3P48764 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC9A3P48764 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC9A3P48764 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC9A3P48764 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC9A3P48764 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC9A3P48764 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC9A3P48764 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC9A3P48764 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC9A3P48764 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC9A3P48764 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC9A3P48764 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC9A3P48764 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC9A3P48764 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC9A3P48764 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC9A3P48764 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC9A3P48764 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC9A3P48764 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A3P48764 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A3P48764 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A3P48764 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A3P48764 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A3P48764 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A3P48764 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A3P48764 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A3P48764 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A3P48764 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC9A3P48764 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC9A3P48764 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC9A3P48764 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC9A3P48764 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC9A3P48764 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC9A3P48764 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC9A3P48764 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC9A3P48764 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC9A3P48764 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC9A3P48764 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC9A3P48764 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLC9A3P48764 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC9A3P48764 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC9A3P48764 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC9A3P48764 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC9A3P48764 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC9A3P48764 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC9A3P48764 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC9A3P48764 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC9A3P48764 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC9A3P48764 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC9A3P48764 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC9A3P48764 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC9A3P48764 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A3P48764 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A3P48764 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A3P48764 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A3P48764 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A3P48764 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A3P48764 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A3P48764 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A3P48764 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC9A3P48764 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC9A3P48764 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC9A3P48764 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC9A3P48764 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC9A3P48764 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC9A3P48764 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC9A3P48764 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC9A3P48764 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC9A3P48764 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC9A3P48764 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC9A3P48764 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC9A3P48764 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC9A3P48764 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC9A3P48764 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC9A3P48764 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC9A3P48764 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC9A3P48764 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC9A3P48764 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC9A3P48764 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC9A3P48764 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC9A3P48764 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A3P48764 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A3P48764 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A3P48764 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9A3P48764 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9A3P48764 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9A3P48764 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9A3P48764 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms