Protein–RNA interactions for Protein: P48052

CPA2, Carboxypeptidase A2, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA2P48052 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CPA2P48052 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CPA2P48052 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPA2P48052 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CPA2P48052 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CPA2P48052 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CPA2P48052 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPA2P48052 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPA2P48052 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPA2P48052 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CPA2P48052 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPA2P48052 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPA2P48052 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CPA2P48052 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CPA2P48052 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CPA2P48052 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CPA2P48052 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CPA2P48052 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPA2P48052 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPA2P48052 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPA2P48052 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CPA2P48052 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPA2P48052 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPA2P48052 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPA2P48052 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CPA2P48052 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPA2P48052 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CPA2P48052 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPA2P48052 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPA2P48052 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPA2P48052 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPA2P48052 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPA2P48052 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPA2P48052 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPA2P48052 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPA2P48052 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPA2P48052 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPA2P48052 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPA2P48052 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPA2P48052 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPA2P48052 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPA2P48052 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CPA2P48052 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CPA2P48052 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CPA2P48052 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CPA2P48052 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPA2P48052 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPA2P48052 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPA2P48052 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPA2P48052 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPA2P48052 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPA2P48052 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPA2P48052 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPA2P48052 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CPA2P48052 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPA2P48052 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPA2P48052 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPA2P48052 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPA2P48052 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPA2P48052 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CPA2P48052 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPA2P48052 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPA2P48052 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPA2P48052 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CPA2P48052 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CPA2P48052 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPA2P48052 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CPA2P48052 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPA2P48052 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPA2P48052 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPA2P48052 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPA2P48052 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPA2P48052 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPA2P48052 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPA2P48052 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPA2P48052 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPA2P48052 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPA2P48052 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPA2P48052 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CPA2P48052 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPA2P48052 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPA2P48052 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPA2P48052 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPA2P48052 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPA2P48052 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPA2P48052 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPA2P48052 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPA2P48052 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPA2P48052 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPA2P48052 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPA2P48052 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CPA2P48052 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPA2P48052 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPA2P48052 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPA2P48052 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPA2P48052 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPA2P48052 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPA2P48052 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPA2P48052 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPA2P48052 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms