Protein–RNA interactions for Protein: P45844

ABCG1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG1P45844 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCG1P45844 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCG1P45844 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCG1P45844 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCG1P45844 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCG1P45844 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCG1P45844 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCG1P45844 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCG1P45844 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCG1P45844 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCG1P45844 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCG1P45844 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCG1P45844 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCG1P45844 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCG1P45844 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCG1P45844 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCG1P45844 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCG1P45844 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCG1P45844 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCG1P45844 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCG1P45844 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCG1P45844 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCG1P45844 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCG1P45844 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCG1P45844 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCG1P45844 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCG1P45844 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCG1P45844 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCG1P45844 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCG1P45844 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCG1P45844 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCG1P45844 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCG1P45844 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCG1P45844 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCG1P45844 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCG1P45844 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCG1P45844 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCG1P45844 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCG1P45844 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCG1P45844 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCG1P45844 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCG1P45844 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCG1P45844 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCG1P45844 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCG1P45844 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCG1P45844 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCG1P45844 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCG1P45844 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ABCG1P45844 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ABCG1P45844 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCG1P45844 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCG1P45844 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCG1P45844 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCG1P45844 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCG1P45844 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCG1P45844 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCG1P45844 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCG1P45844 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCG1P45844 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCG1P45844 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCG1P45844 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCG1P45844 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCG1P45844 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCG1P45844 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCG1P45844 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCG1P45844 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCG1P45844 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCG1P45844 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCG1P45844 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCG1P45844 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCG1P45844 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCG1P45844 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCG1P45844 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCG1P45844 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCG1P45844 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCG1P45844 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCG1P45844 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCG1P45844 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCG1P45844 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCG1P45844 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCG1P45844 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCG1P45844 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCG1P45844 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCG1P45844 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCG1P45844 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCG1P45844 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCG1P45844 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCG1P45844 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCG1P45844 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCG1P45844 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCG1P45844 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCG1P45844 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCG1P45844 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCG1P45844 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCG1P45844 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCG1P45844 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCG1P45844 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCG1P45844 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCG1P45844 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCG1P45844 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms