Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2IP36954 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2IP36954 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR2IP36954 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR2IP36954 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR2IP36954 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR2IP36954 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR2IP36954 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR2IP36954 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR2IP36954 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR2IP36954 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2IP36954 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2IP36954 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2IP36954 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2IP36954 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR2IP36954 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR2IP36954 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR2IP36954 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR2IP36954 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR2IP36954 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR2IP36954 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR2IP36954 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2IP36954 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2IP36954 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2IP36954 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2IP36954 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2IP36954 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2IP36954 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR2IP36954 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2IP36954 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2IP36954 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2IP36954 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2IP36954 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2IP36954 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR2IP36954 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR2IP36954 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR2IP36954 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2IP36954 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2IP36954 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2IP36954 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2IP36954 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2IP36954 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR2IP36954 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2IP36954 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2IP36954 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2IP36954 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2IP36954 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2IP36954 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR2IP36954 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR2IP36954 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2IP36954 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2IP36954 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2IP36954 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2IP36954 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2IP36954 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR2IP36954 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2IP36954 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2IP36954 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2IP36954 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2IP36954 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR2IP36954 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2IP36954 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2IP36954 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2IP36954 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLR2IP36954 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2IP36954 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2IP36954 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2IP36954 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2IP36954 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2IP36954 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2IP36954 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2IP36954 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2IP36954 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2IP36954 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2IP36954 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2IP36954 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2IP36954 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2IP36954 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2IP36954 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2IP36954 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2IP36954 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2IP36954 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2IP36954 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2IP36954 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2IP36954 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2IP36954 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2IP36954 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2IP36954 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2IP36954 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2IP36954 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2IP36954 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2IP36954 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2IP36954 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2IP36954 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2IP36954 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR2IP36954 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR2IP36954 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR2IP36954 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR2IP36954 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR2IP36954 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms