Protein–RNA interactions for Protein: P34995

PTGER1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER1P34995 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTGER1P34995 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTGER1P34995 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTGER1P34995 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTGER1P34995 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTGER1P34995 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGER1P34995 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGER1P34995 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGER1P34995 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGER1P34995 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGER1P34995 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTGER1P34995 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTGER1P34995 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTGER1P34995 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTGER1P34995 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTGER1P34995 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTGER1P34995 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGER1P34995 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGER1P34995 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGER1P34995 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGER1P34995 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGER1P34995 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGER1P34995 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTGER1P34995 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTGER1P34995 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTGER1P34995 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTGER1P34995 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTGER1P34995 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTGER1P34995 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTGER1P34995 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTGER1P34995 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTGER1P34995 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTGER1P34995 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTGER1P34995 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTGER1P34995 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTGER1P34995 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTGER1P34995 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTGER1P34995 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTGER1P34995 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTGER1P34995 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGER1P34995 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGER1P34995 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGER1P34995 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGER1P34995 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGER1P34995 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGER1P34995 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGER1P34995 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGER1P34995 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGER1P34995 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGER1P34995 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGER1P34995 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGER1P34995 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTGER1P34995 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTGER1P34995 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTGER1P34995 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTGER1P34995 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTGER1P34995 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTGER1P34995 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTGER1P34995 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTGER1P34995 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTGER1P34995 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTGER1P34995 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGER1P34995 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGER1P34995 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGER1P34995 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGER1P34995 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGER1P34995 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGER1P34995 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGER1P34995 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGER1P34995 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGER1P34995 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGER1P34995 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGER1P34995 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGER1P34995 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGER1P34995 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGER1P34995 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGER1P34995 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGER1P34995 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGER1P34995 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGER1P34995 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTGER1P34995 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTGER1P34995 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PTGER1P34995 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTGER1P34995 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTGER1P34995 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGER1P34995 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGER1P34995 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTGER1P34995 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGER1P34995 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGER1P34995 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGER1P34995 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGER1P34995 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGER1P34995 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGER1P34995 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGER1P34995 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGER1P34995 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGER1P34995 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGER1P34995 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGER1P34995 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGER1P34995 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms