Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
POLD1P28340 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
POLD1P28340 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
POLD1P28340 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
POLD1P28340 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
POLD1P28340 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
POLD1P28340 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
POLD1P28340 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
POLD1P28340 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
POLD1P28340 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
POLD1P28340 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
POLD1P28340 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
POLD1P28340 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
POLD1P28340 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
POLD1P28340 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
POLD1P28340 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
POLD1P28340 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
POLD1P28340 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
POLD1P28340 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
POLD1P28340 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
POLD1P28340 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
POLD1P28340 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
POLD1P28340 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
POLD1P28340 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
POLD1P28340 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
POLD1P28340 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
POLD1P28340 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
POLD1P28340 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
POLD1P28340 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
POLD1P28340 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
POLD1P28340 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
POLD1P28340 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
POLD1P28340 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
POLD1P28340 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
POLD1P28340 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
POLD1P28340 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
POLD1P28340 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
POLD1P28340 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
POLD1P28340 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
POLD1P28340 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
POLD1P28340 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
POLD1P28340 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
POLD1P28340 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
POLD1P28340 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
POLD1P28340 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
POLD1P28340 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
POLD1P28340 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
POLD1P28340 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
POLD1P28340 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
POLD1P28340 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
POLD1P28340 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
POLD1P28340 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
POLD1P28340 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
POLD1P28340 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
POLD1P28340 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
POLD1P28340 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
POLD1P28340 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
POLD1P28340 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
POLD1P28340 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
POLD1P28340 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
POLD1P28340 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
POLD1P28340 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
POLD1P28340 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
POLD1P28340 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
POLD1P28340 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
POLD1P28340 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
POLD1P28340 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.73
POLD1P28340 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
POLD1P28340 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
POLD1P28340 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
POLD1P28340 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
POLD1P28340 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
POLD1P28340 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
POLD1P28340 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
POLD1P28340 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
POLD1P28340 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
POLD1P28340 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
POLD1P28340 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
POLD1P28340 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
POLD1P28340 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
POLD1P28340 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
POLD1P28340 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
POLD1P28340 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
POLD1P28340 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
POLD1P28340 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
POLD1P28340 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC31.99■■■□□ 2.71
POLD1P28340 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
POLD1P28340 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
POLD1P28340 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
POLD1P28340 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
POLD1P28340 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
POLD1P28340 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
POLD1P28340 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
POLD1P28340 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
POLD1P28340 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
POLD1P28340 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
POLD1P28340 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
POLD1P28340 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
POLD1P28340 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
POLD1P28340 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms