Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
HMGB2P26583 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
HMGB2P26583 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
HMGB2P26583 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
HMGB2P26583 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
HMGB2P26583 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
HMGB2P26583 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
HMGB2P26583 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
HMGB2P26583 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
HMGB2P26583 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
HMGB2P26583 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
HMGB2P26583 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
HMGB2P26583 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
HMGB2P26583 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
HMGB2P26583 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
HMGB2P26583 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
HMGB2P26583 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
HMGB2P26583 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
HMGB2P26583 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
HMGB2P26583 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
HMGB2P26583 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
HMGB2P26583 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
HMGB2P26583 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
HMGB2P26583 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
HMGB2P26583 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
HMGB2P26583 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
HMGB2P26583 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
HMGB2P26583 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
HMGB2P26583 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
HMGB2P26583 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
HMGB2P26583 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
HMGB2P26583 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
HMGB2P26583 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
HMGB2P26583 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
HMGB2P26583 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
HMGB2P26583 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
HMGB2P26583 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
HMGB2P26583 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
HMGB2P26583 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
HMGB2P26583 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
HMGB2P26583 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
HMGB2P26583 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
HMGB2P26583 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
HMGB2P26583 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
HMGB2P26583 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
HMGB2P26583 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
HMGB2P26583 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
HMGB2P26583 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
HMGB2P26583 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
HMGB2P26583 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
HMGB2P26583 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
HMGB2P26583 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC32.42■■■□□ 2.78
HMGB2P26583 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
HMGB2P26583 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
HMGB2P26583 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
HMGB2P26583 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
HMGB2P26583 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
HMGB2P26583 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
HMGB2P26583 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
HMGB2P26583 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
HMGB2P26583 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
HMGB2P26583 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
HMGB2P26583 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
HMGB2P26583 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
HMGB2P26583 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
HMGB2P26583 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
HMGB2P26583 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
HMGB2P26583 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
HMGB2P26583 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
HMGB2P26583 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
HMGB2P26583 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
HMGB2P26583 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
HMGB2P26583 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
HMGB2P26583 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
HMGB2P26583 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
HMGB2P26583 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
HMGB2P26583 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
HMGB2P26583 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
HMGB2P26583 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
HMGB2P26583 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
HMGB2P26583 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
HMGB2P26583 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
HMGB2P26583 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
HMGB2P26583 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
HMGB2P26583 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
HMGB2P26583 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
HMGB2P26583 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
HMGB2P26583 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
HMGB2P26583 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
HMGB2P26583 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
HMGB2P26583 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
HMGB2P26583 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
HMGB2P26583 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
HMGB2P26583 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
HMGB2P26583 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
HMGB2P26583 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
HMGB2P26583 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
HMGB2P26583 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
HMGB2P26583 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
HMGB2P26583 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms