Protein–RNA interactions for Protein: P24522

GADD45A, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45AP24522 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GADD45AP24522 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GADD45AP24522 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GADD45AP24522 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GADD45AP24522 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GADD45AP24522 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GADD45AP24522 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GADD45AP24522 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GADD45AP24522 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GADD45AP24522 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GADD45AP24522 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GADD45AP24522 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GADD45AP24522 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GADD45AP24522 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GADD45AP24522 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GADD45AP24522 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GADD45AP24522 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GADD45AP24522 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GADD45AP24522 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GADD45AP24522 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GADD45AP24522 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GADD45AP24522 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GADD45AP24522 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GADD45AP24522 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GADD45AP24522 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GADD45AP24522 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GADD45AP24522 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GADD45AP24522 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GADD45AP24522 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GADD45AP24522 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GADD45AP24522 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GADD45AP24522 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GADD45AP24522 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GADD45AP24522 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GADD45AP24522 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GADD45AP24522 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GADD45AP24522 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GADD45AP24522 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GADD45AP24522 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GADD45AP24522 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GADD45AP24522 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GADD45AP24522 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GADD45AP24522 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GADD45AP24522 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GADD45AP24522 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GADD45AP24522 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GADD45AP24522 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GADD45AP24522 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GADD45AP24522 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GADD45AP24522 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GADD45AP24522 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GADD45AP24522 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GADD45AP24522 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GADD45AP24522 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GADD45AP24522 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GADD45AP24522 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GADD45AP24522 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GADD45AP24522 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GADD45AP24522 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GADD45AP24522 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GADD45AP24522 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GADD45AP24522 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GADD45AP24522 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GADD45AP24522 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GADD45AP24522 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GADD45AP24522 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GADD45AP24522 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GADD45AP24522 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GADD45AP24522 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GADD45AP24522 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GADD45AP24522 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GADD45AP24522 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GADD45AP24522 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GADD45AP24522 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GADD45AP24522 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GADD45AP24522 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GADD45AP24522 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GADD45AP24522 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GADD45AP24522 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GADD45AP24522 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GADD45AP24522 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GADD45AP24522 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GADD45AP24522 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GADD45AP24522 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GADD45AP24522 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GADD45AP24522 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GADD45AP24522 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GADD45AP24522 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GADD45AP24522 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GADD45AP24522 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GADD45AP24522 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GADD45AP24522 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GADD45AP24522 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GADD45AP24522 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GADD45AP24522 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GADD45AP24522 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GADD45AP24522 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GADD45AP24522 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GADD45AP24522 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GADD45AP24522 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms