Protein–RNA interactions for Protein: P22531

SPRR2E, Small proline-rich protein 2E, humanhuman

Predictions only

Length 72 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR2EP22531 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR2EP22531 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR2EP22531 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR2EP22531 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR2EP22531 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SPRR2EP22531 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPRR2EP22531 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPRR2EP22531 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPRR2EP22531 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
SPRR2EP22531 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPRR2EP22531 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
SPRR2EP22531 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR2EP22531 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR2EP22531 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR2EP22531 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR2EP22531 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR2EP22531 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR2EP22531 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR2EP22531 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR2EP22531 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR2EP22531 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR2EP22531 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR2EP22531 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR2EP22531 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR2EP22531 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR2EP22531 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR2EP22531 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR2EP22531 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR2EP22531 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR2EP22531 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR2EP22531 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR2EP22531 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR2EP22531 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR2EP22531 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR2EP22531 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR2EP22531 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR2EP22531 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR2EP22531 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR2EP22531 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR2EP22531 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR2EP22531 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR2EP22531 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR2EP22531 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR2EP22531 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SPRR2EP22531 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR2EP22531 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR2EP22531 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR2EP22531 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR2EP22531 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR2EP22531 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SPRR2EP22531 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPRR2EP22531 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPRR2EP22531 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPRR2EP22531 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPRR2EP22531 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPRR2EP22531 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPRR2EP22531 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPRR2EP22531 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
SPRR2EP22531 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR2EP22531 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR2EP22531 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR2EP22531 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR2EP22531 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR2EP22531 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR2EP22531 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR2EP22531 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR2EP22531 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR2EP22531 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR2EP22531 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR2EP22531 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR2EP22531 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR2EP22531 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
SPRR2EP22531 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR2EP22531 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR2EP22531 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR2EP22531 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR2EP22531 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR2EP22531 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR2EP22531 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR2EP22531 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR2EP22531 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPRR2EP22531 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR2EP22531 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR2EP22531 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR2EP22531 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR2EP22531 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR2EP22531 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR2EP22531 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR2EP22531 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR2EP22531 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR2EP22531 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR2EP22531 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR2EP22531 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR2EP22531 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
SPRR2EP22531 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR2EP22531 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR2EP22531 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR2EP22531 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR2EP22531 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SPRR2EP22531 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms