Protein–RNA interactions for Protein: P21246

PTN, Pleiotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTNP21246 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTNP21246 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTNP21246 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTNP21246 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTNP21246 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTNP21246 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTNP21246 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTNP21246 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTNP21246 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTNP21246 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTNP21246 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTNP21246 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTNP21246 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTNP21246 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTNP21246 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTNP21246 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTNP21246 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTNP21246 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTNP21246 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTNP21246 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTNP21246 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTNP21246 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTNP21246 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTNP21246 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTNP21246 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTNP21246 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTNP21246 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTNP21246 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTNP21246 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTNP21246 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTNP21246 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTNP21246 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTNP21246 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTNP21246 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTNP21246 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTNP21246 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTNP21246 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTNP21246 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTNP21246 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTNP21246 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTNP21246 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTNP21246 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTNP21246 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTNP21246 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTNP21246 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTNP21246 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTNP21246 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTNP21246 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTNP21246 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTNP21246 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTNP21246 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTNP21246 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTNP21246 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTNP21246 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTNP21246 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTNP21246 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTNP21246 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTNP21246 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PTNP21246 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTNP21246 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTNP21246 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTNP21246 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTNP21246 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PTNP21246 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTNP21246 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTNP21246 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTNP21246 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTNP21246 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTNP21246 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTNP21246 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTNP21246 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTNP21246 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTNP21246 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTNP21246 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTNP21246 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTNP21246 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTNP21246 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTNP21246 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTNP21246 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTNP21246 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTNP21246 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTNP21246 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTNP21246 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTNP21246 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTNP21246 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTNP21246 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTNP21246 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTNP21246 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTNP21246 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTNP21246 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTNP21246 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTNP21246 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTNP21246 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTNP21246 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTNP21246 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTNP21246 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTNP21246 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTNP21246 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTNP21246 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTNP21246 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms