Protein–RNA interactions for Protein: P17658

KCNA6, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 6, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA6P17658 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
KCNA6P17658 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
KCNA6P17658 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
KCNA6P17658 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC36.12■■■■□ 3.37
KCNA6P17658 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC36.12■■■■□ 3.37
KCNA6P17658 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
KCNA6P17658 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
KCNA6P17658 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
KCNA6P17658 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
KCNA6P17658 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
KCNA6P17658 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
KCNA6P17658 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
KCNA6P17658 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
KCNA6P17658 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
KCNA6P17658 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
KCNA6P17658 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
KCNA6P17658 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
KCNA6P17658 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
KCNA6P17658 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
KCNA6P17658 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
KCNA6P17658 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
KCNA6P17658 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
KCNA6P17658 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
KCNA6P17658 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
KCNA6P17658 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
KCNA6P17658 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
KCNA6P17658 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
KCNA6P17658 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
KCNA6P17658 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
KCNA6P17658 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
KCNA6P17658 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
KCNA6P17658 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
KCNA6P17658 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
KCNA6P17658 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
KCNA6P17658 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
KCNA6P17658 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
KCNA6P17658 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
KCNA6P17658 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
KCNA6P17658 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
KCNA6P17658 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
KCNA6P17658 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
KCNA6P17658 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
KCNA6P17658 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
KCNA6P17658 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
KCNA6P17658 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
KCNA6P17658 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
KCNA6P17658 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
KCNA6P17658 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
KCNA6P17658 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
KCNA6P17658 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
KCNA6P17658 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
KCNA6P17658 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
KCNA6P17658 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
KCNA6P17658 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
KCNA6P17658 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
KCNA6P17658 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
KCNA6P17658 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
KCNA6P17658 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
KCNA6P17658 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC35.92■■■■□ 3.34
KCNA6P17658 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
KCNA6P17658 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
KCNA6P17658 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
KCNA6P17658 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
KCNA6P17658 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
KCNA6P17658 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
KCNA6P17658 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
KCNA6P17658 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
KCNA6P17658 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
KCNA6P17658 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
KCNA6P17658 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
KCNA6P17658 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
KCNA6P17658 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC35.88■■■■□ 3.34
KCNA6P17658 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
KCNA6P17658 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
KCNA6P17658 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
KCNA6P17658 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
KCNA6P17658 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
KCNA6P17658 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
KCNA6P17658 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
KCNA6P17658 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
KCNA6P17658 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
KCNA6P17658 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
KCNA6P17658 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
KCNA6P17658 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
KCNA6P17658 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
KCNA6P17658 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
KCNA6P17658 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
KCNA6P17658 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
KCNA6P17658 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
KCNA6P17658 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
KCNA6P17658 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
KCNA6P17658 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
KCNA6P17658 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
KCNA6P17658 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
KCNA6P17658 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
KCNA6P17658 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
KCNA6P17658 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
KCNA6P17658 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
KCNA6P17658 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.83■■■■□ 3.33
KCNA6P17658 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms