Protein–RNA interactions for Protein: P17658

KCNA6, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 6, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA6P17658 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
KCNA6P17658 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
KCNA6P17658 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
KCNA6P17658 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC36.12■■■■□ 3.37
KCNA6P17658 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC36.12■■■■□ 3.37
KCNA6P17658 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
KCNA6P17658 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
KCNA6P17658 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
KCNA6P17658 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
KCNA6P17658 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
KCNA6P17658 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
KCNA6P17658 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
KCNA6P17658 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
KCNA6P17658 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
KCNA6P17658 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
KCNA6P17658 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
KCNA6P17658 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
KCNA6P17658 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
KCNA6P17658 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
KCNA6P17658 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
KCNA6P17658 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
KCNA6P17658 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
KCNA6P17658 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
KCNA6P17658 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
KCNA6P17658 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
KCNA6P17658 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
KCNA6P17658 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
KCNA6P17658 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
KCNA6P17658 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
KCNA6P17658 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
KCNA6P17658 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
KCNA6P17658 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
KCNA6P17658 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
KCNA6P17658 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
KCNA6P17658 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
KCNA6P17658 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
KCNA6P17658 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
KCNA6P17658 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
KCNA6P17658 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
KCNA6P17658 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
KCNA6P17658 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
KCNA6P17658 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
KCNA6P17658 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
KCNA6P17658 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
KCNA6P17658 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
KCNA6P17658 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
KCNA6P17658 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
KCNA6P17658 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
KCNA6P17658 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
KCNA6P17658 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
KCNA6P17658 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
KCNA6P17658 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
KCNA6P17658 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
KCNA6P17658 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
KCNA6P17658 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
KCNA6P17658 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
KCNA6P17658 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
KCNA6P17658 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
KCNA6P17658 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC35.92■■■■□ 3.34
KCNA6P17658 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
KCNA6P17658 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
KCNA6P17658 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
KCNA6P17658 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
KCNA6P17658 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
KCNA6P17658 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
KCNA6P17658 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
KCNA6P17658 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
KCNA6P17658 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
KCNA6P17658 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
KCNA6P17658 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
KCNA6P17658 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
KCNA6P17658 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC35.88■■■■□ 3.34
KCNA6P17658 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
KCNA6P17658 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
KCNA6P17658 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
KCNA6P17658 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
KCNA6P17658 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
KCNA6P17658 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
KCNA6P17658 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
KCNA6P17658 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
KCNA6P17658 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
KCNA6P17658 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
KCNA6P17658 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
KCNA6P17658 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
KCNA6P17658 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
KCNA6P17658 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
KCNA6P17658 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
KCNA6P17658 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
KCNA6P17658 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
KCNA6P17658 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
KCNA6P17658 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
KCNA6P17658 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
KCNA6P17658 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
KCNA6P17658 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
KCNA6P17658 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
KCNA6P17658 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
KCNA6P17658 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
KCNA6P17658 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
KCNA6P17658 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.83■■■■□ 3.33
KCNA6P17658 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms