Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CREB1P16220 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CREB1P16220 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CREB1P16220 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CREB1P16220 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CREB1P16220 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CREB1P16220 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CREB1P16220 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CREB1P16220 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CREB1P16220 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CREB1P16220 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CREB1P16220 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CREB1P16220 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CREB1P16220 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CREB1P16220 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CREB1P16220 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CREB1P16220 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CREB1P16220 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CREB1P16220 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CREB1P16220 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CREB1P16220 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CREB1P16220 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CREB1P16220 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CREB1P16220 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CREB1P16220 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CREB1P16220 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CREB1P16220 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CREB1P16220 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CREB1P16220 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CREB1P16220 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CREB1P16220 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CREB1P16220 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CREB1P16220 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CREB1P16220 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CREB1P16220 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CREB1P16220 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CREB1P16220 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CREB1P16220 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CREB1P16220 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CREB1P16220 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CREB1P16220 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CREB1P16220 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CREB1P16220 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CREB1P16220 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CREB1P16220 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CREB1P16220 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CREB1P16220 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CREB1P16220 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CREB1P16220 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CREB1P16220 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CREB1P16220 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CREB1P16220 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CREB1P16220 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CREB1P16220 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CREB1P16220 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CREB1P16220 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CREB1P16220 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CREB1P16220 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CREB1P16220 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CREB1P16220 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CREB1P16220 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CREB1P16220 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CREB1P16220 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CREB1P16220 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CREB1P16220 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CREB1P16220 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CREB1P16220 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CREB1P16220 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CREB1P16220 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CREB1P16220 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CREB1P16220 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
CREB1P16220 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CREB1P16220 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CREB1P16220 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CREB1P16220 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CREB1P16220 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CREB1P16220 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CREB1P16220 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CREB1P16220 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CREB1P16220 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CREB1P16220 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CREB1P16220 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CREB1P16220 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CREB1P16220 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CREB1P16220 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CREB1P16220 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CREB1P16220 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CREB1P16220 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CREB1P16220 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CREB1P16220 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CREB1P16220 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CREB1P16220 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CREB1P16220 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CREB1P16220 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CREB1P16220 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CREB1P16220 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
CREB1P16220 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CREB1P16220 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CREB1P16220 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CREB1P16220 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms