Protein–RNA interactions for Protein: P11509

CYP2A6, Cytochrome P450 2A6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2A6P11509 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP2A6P11509 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP2A6P11509 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP2A6P11509 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP2A6P11509 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP2A6P11509 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP2A6P11509 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP2A6P11509 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP2A6P11509 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP2A6P11509 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP2A6P11509 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP2A6P11509 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP2A6P11509 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP2A6P11509 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP2A6P11509 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP2A6P11509 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP2A6P11509 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP2A6P11509 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP2A6P11509 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP2A6P11509 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP2A6P11509 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP2A6P11509 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP2A6P11509 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP2A6P11509 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP2A6P11509 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP2A6P11509 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP2A6P11509 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP2A6P11509 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP2A6P11509 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP2A6P11509 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP2A6P11509 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP2A6P11509 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP2A6P11509 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP2A6P11509 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP2A6P11509 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP2A6P11509 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP2A6P11509 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP2A6P11509 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP2A6P11509 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP2A6P11509 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP2A6P11509 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP2A6P11509 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP2A6P11509 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CYP2A6P11509 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP2A6P11509 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP2A6P11509 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP2A6P11509 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP2A6P11509 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP2A6P11509 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP2A6P11509 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP2A6P11509 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP2A6P11509 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP2A6P11509 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP2A6P11509 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP2A6P11509 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP2A6P11509 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP2A6P11509 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP2A6P11509 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP2A6P11509 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP2A6P11509 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP2A6P11509 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP2A6P11509 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP2A6P11509 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP2A6P11509 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP2A6P11509 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP2A6P11509 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYP2A6P11509 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYP2A6P11509 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYP2A6P11509 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYP2A6P11509 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CYP2A6P11509 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CYP2A6P11509 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CYP2A6P11509 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CYP2A6P11509 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CYP2A6P11509 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYP2A6P11509 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYP2A6P11509 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYP2A6P11509 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYP2A6P11509 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYP2A6P11509 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYP2A6P11509 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYP2A6P11509 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYP2A6P11509 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYP2A6P11509 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYP2A6P11509 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP2A6P11509 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP2A6P11509 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP2A6P11509 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP2A6P11509 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP2A6P11509 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP2A6P11509 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP2A6P11509 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP2A6P11509 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CYP2A6P11509 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CYP2A6P11509 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYP2A6P11509 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CYP2A6P11509 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYP2A6P11509 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYP2A6P11509 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYP2A6P11509 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms