Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC166P0CW27 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC166P0CW27 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC166P0CW27 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC166P0CW27 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC166P0CW27 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC166P0CW27 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC166P0CW27 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC166P0CW27 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC166P0CW27 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC166P0CW27 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC166P0CW27 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC166P0CW27 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC166P0CW27 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC166P0CW27 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC166P0CW27 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC166P0CW27 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC166P0CW27 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC166P0CW27 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC166P0CW27 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC166P0CW27 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC166P0CW27 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC166P0CW27 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC166P0CW27 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC166P0CW27 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC166P0CW27 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC166P0CW27 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC166P0CW27 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC166P0CW27 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC166P0CW27 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC166P0CW27 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC166P0CW27 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC166P0CW27 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC166P0CW27 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC166P0CW27 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC166P0CW27 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC166P0CW27 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC166P0CW27 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC166P0CW27 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC166P0CW27 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC166P0CW27 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC166P0CW27 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC166P0CW27 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC166P0CW27 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC166P0CW27 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC166P0CW27 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC166P0CW27 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC166P0CW27 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC166P0CW27 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC166P0CW27 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC166P0CW27 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC166P0CW27 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC166P0CW27 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC166P0CW27 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC166P0CW27 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC166P0CW27 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC166P0CW27 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC166P0CW27 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC166P0CW27 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC166P0CW27 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC166P0CW27 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC166P0CW27 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC166P0CW27 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC166P0CW27 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC166P0CW27 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC166P0CW27 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC166P0CW27 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC166P0CW27 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC166P0CW27 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC166P0CW27 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC166P0CW27 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC166P0CW27 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC166P0CW27 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC166P0CW27 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC166P0CW27 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC166P0CW27 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC166P0CW27 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC166P0CW27 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC166P0CW27 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC166P0CW27 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC166P0CW27 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC166P0CW27 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC166P0CW27 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC166P0CW27 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC166P0CW27 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC166P0CW27 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC166P0CW27 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC166P0CW27 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC166P0CW27 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC166P0CW27 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC166P0CW27 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC166P0CW27 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC166P0CW27 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC166P0CW27 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC166P0CW27 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC166P0CW27 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC166P0CW27 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC166P0CW27 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC166P0CW27 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC166P0CW27 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms