Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I6

CCDC159, Coiled-coil domain-containing protein 159, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC159P0C7I6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC159P0C7I6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC159P0C7I6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC159P0C7I6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC159P0C7I6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC159P0C7I6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC159P0C7I6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC159P0C7I6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC159P0C7I6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC159P0C7I6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC159P0C7I6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC159P0C7I6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC159P0C7I6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC159P0C7I6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC159P0C7I6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC159P0C7I6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC159P0C7I6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC159P0C7I6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC159P0C7I6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC159P0C7I6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC159P0C7I6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC159P0C7I6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC159P0C7I6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC159P0C7I6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC159P0C7I6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC159P0C7I6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC159P0C7I6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC159P0C7I6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC159P0C7I6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC159P0C7I6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC159P0C7I6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC159P0C7I6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC159P0C7I6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC159P0C7I6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC159P0C7I6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC159P0C7I6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC159P0C7I6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC159P0C7I6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC159P0C7I6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC159P0C7I6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC159P0C7I6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC159P0C7I6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC159P0C7I6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC159P0C7I6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC159P0C7I6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC159P0C7I6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC159P0C7I6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC159P0C7I6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC159P0C7I6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC159P0C7I6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC159P0C7I6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC159P0C7I6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC159P0C7I6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC159P0C7I6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC159P0C7I6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC159P0C7I6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC159P0C7I6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC159P0C7I6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC159P0C7I6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC159P0C7I6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC159P0C7I6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC159P0C7I6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC159P0C7I6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC159P0C7I6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC159P0C7I6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC159P0C7I6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC159P0C7I6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC159P0C7I6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC159P0C7I6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC159P0C7I6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC159P0C7I6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC159P0C7I6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC159P0C7I6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC159P0C7I6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC159P0C7I6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC159P0C7I6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC159P0C7I6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC159P0C7I6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC159P0C7I6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC159P0C7I6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC159P0C7I6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC159P0C7I6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC159P0C7I6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC159P0C7I6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC159P0C7I6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC159P0C7I6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC159P0C7I6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC159P0C7I6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC159P0C7I6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC159P0C7I6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC159P0C7I6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC159P0C7I6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC159P0C7I6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC159P0C7I6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC159P0C7I6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC159P0C7I6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC159P0C7I6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC159P0C7I6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC159P0C7I6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC159P0C7I6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms