Protein–RNA interactions for Protein: O95522

PRAMEF12, PRAME family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF12O95522 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRAMEF12O95522 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRAMEF12O95522 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PRAMEF12O95522 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRAMEF12O95522 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRAMEF12O95522 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRAMEF12O95522 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRAMEF12O95522 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRAMEF12O95522 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRAMEF12O95522 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PRAMEF12O95522 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRAMEF12O95522 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRAMEF12O95522 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRAMEF12O95522 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRAMEF12O95522 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRAMEF12O95522 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRAMEF12O95522 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRAMEF12O95522 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRAMEF12O95522 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRAMEF12O95522 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRAMEF12O95522 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRAMEF12O95522 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRAMEF12O95522 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRAMEF12O95522 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRAMEF12O95522 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRAMEF12O95522 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRAMEF12O95522 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRAMEF12O95522 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRAMEF12O95522 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRAMEF12O95522 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRAMEF12O95522 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRAMEF12O95522 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PRAMEF12O95522 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRAMEF12O95522 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRAMEF12O95522 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRAMEF12O95522 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRAMEF12O95522 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PRAMEF12O95522 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PRAMEF12O95522 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRAMEF12O95522 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRAMEF12O95522 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRAMEF12O95522 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PRAMEF12O95522 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRAMEF12O95522 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRAMEF12O95522 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRAMEF12O95522 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRAMEF12O95522 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRAMEF12O95522 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRAMEF12O95522 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRAMEF12O95522 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PRAMEF12O95522 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRAMEF12O95522 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRAMEF12O95522 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRAMEF12O95522 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRAMEF12O95522 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PRAMEF12O95522 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRAMEF12O95522 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRAMEF12O95522 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRAMEF12O95522 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRAMEF12O95522 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRAMEF12O95522 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRAMEF12O95522 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRAMEF12O95522 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRAMEF12O95522 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRAMEF12O95522 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRAMEF12O95522 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRAMEF12O95522 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRAMEF12O95522 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PRAMEF12O95522 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRAMEF12O95522 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRAMEF12O95522 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRAMEF12O95522 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRAMEF12O95522 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRAMEF12O95522 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRAMEF12O95522 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRAMEF12O95522 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRAMEF12O95522 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRAMEF12O95522 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PRAMEF12O95522 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRAMEF12O95522 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRAMEF12O95522 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRAMEF12O95522 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRAMEF12O95522 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRAMEF12O95522 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRAMEF12O95522 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRAMEF12O95522 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRAMEF12O95522 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRAMEF12O95522 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRAMEF12O95522 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRAMEF12O95522 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRAMEF12O95522 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRAMEF12O95522 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRAMEF12O95522 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRAMEF12O95522 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRAMEF12O95522 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRAMEF12O95522 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRAMEF12O95522 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRAMEF12O95522 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRAMEF12O95522 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRAMEF12O95522 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms