Protein–RNA interactions for Protein: O95470

SGPL1, Sphingosine-1-phosphate lyase 1, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGPL1O95470 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SGPL1O95470 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SGPL1O95470 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SGPL1O95470 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SGPL1O95470 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SGPL1O95470 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SGPL1O95470 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SGPL1O95470 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SGPL1O95470 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SGPL1O95470 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SGPL1O95470 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SGPL1O95470 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SGPL1O95470 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SGPL1O95470 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SGPL1O95470 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SGPL1O95470 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SGPL1O95470 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SGPL1O95470 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SGPL1O95470 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SGPL1O95470 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SGPL1O95470 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SGPL1O95470 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SGPL1O95470 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SGPL1O95470 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SGPL1O95470 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SGPL1O95470 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SGPL1O95470 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SGPL1O95470 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SGPL1O95470 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SGPL1O95470 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SGPL1O95470 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SGPL1O95470 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SGPL1O95470 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SGPL1O95470 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SGPL1O95470 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SGPL1O95470 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SGPL1O95470 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SGPL1O95470 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SGPL1O95470 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SGPL1O95470 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SGPL1O95470 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SGPL1O95470 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SGPL1O95470 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SGPL1O95470 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SGPL1O95470 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SGPL1O95470 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SGPL1O95470 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SGPL1O95470 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SGPL1O95470 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SGPL1O95470 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SGPL1O95470 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SGPL1O95470 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SGPL1O95470 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SGPL1O95470 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SGPL1O95470 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SGPL1O95470 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SGPL1O95470 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SGPL1O95470 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SGPL1O95470 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SGPL1O95470 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SGPL1O95470 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SGPL1O95470 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SGPL1O95470 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SGPL1O95470 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SGPL1O95470 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SGPL1O95470 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SGPL1O95470 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SGPL1O95470 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SGPL1O95470 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SGPL1O95470 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SGPL1O95470 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SGPL1O95470 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SGPL1O95470 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SGPL1O95470 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SGPL1O95470 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SGPL1O95470 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SGPL1O95470 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SGPL1O95470 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SGPL1O95470 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SGPL1O95470 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SGPL1O95470 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SGPL1O95470 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SGPL1O95470 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SGPL1O95470 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SGPL1O95470 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SGPL1O95470 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SGPL1O95470 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SGPL1O95470 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SGPL1O95470 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SGPL1O95470 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SGPL1O95470 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SGPL1O95470 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SGPL1O95470 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SGPL1O95470 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SGPL1O95470 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SGPL1O95470 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SGPL1O95470 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SGPL1O95470 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SGPL1O95470 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SGPL1O95470 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms