Protein–RNA interactions for Protein: O95409

ZIC2, Zinc finger protein ZIC 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC2O95409 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZIC2O95409 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZIC2O95409 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZIC2O95409 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZIC2O95409 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZIC2O95409 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ZIC2O95409 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZIC2O95409 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZIC2O95409 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZIC2O95409 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZIC2O95409 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZIC2O95409 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZIC2O95409 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ZIC2O95409 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZIC2O95409 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZIC2O95409 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZIC2O95409 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZIC2O95409 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZIC2O95409 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZIC2O95409 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZIC2O95409 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZIC2O95409 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZIC2O95409 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZIC2O95409 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZIC2O95409 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZIC2O95409 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ZIC2O95409 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZIC2O95409 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZIC2O95409 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZIC2O95409 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZIC2O95409 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZIC2O95409 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZIC2O95409 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZIC2O95409 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZIC2O95409 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZIC2O95409 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZIC2O95409 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZIC2O95409 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ZIC2O95409 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZIC2O95409 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZIC2O95409 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZIC2O95409 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZIC2O95409 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZIC2O95409 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZIC2O95409 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZIC2O95409 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZIC2O95409 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZIC2O95409 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZIC2O95409 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZIC2O95409 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZIC2O95409 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ZIC2O95409 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZIC2O95409 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZIC2O95409 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZIC2O95409 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ZIC2O95409 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZIC2O95409 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZIC2O95409 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZIC2O95409 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZIC2O95409 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZIC2O95409 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZIC2O95409 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZIC2O95409 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZIC2O95409 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZIC2O95409 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZIC2O95409 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZIC2O95409 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZIC2O95409 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZIC2O95409 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZIC2O95409 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZIC2O95409 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZIC2O95409 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZIC2O95409 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZIC2O95409 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZIC2O95409 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZIC2O95409 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZIC2O95409 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZIC2O95409 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZIC2O95409 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZIC2O95409 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZIC2O95409 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZIC2O95409 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ZIC2O95409 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZIC2O95409 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZIC2O95409 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZIC2O95409 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZIC2O95409 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ZIC2O95409 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZIC2O95409 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ZIC2O95409 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZIC2O95409 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZIC2O95409 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZIC2O95409 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZIC2O95409 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZIC2O95409 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZIC2O95409 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZIC2O95409 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZIC2O95409 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZIC2O95409 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZIC2O95409 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms