Protein–RNA interactions for Protein: O95407

TNFRSF6B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF6BO95407 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF6BO95407 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF6BO95407 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF6BO95407 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF6BO95407 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF6BO95407 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF6BO95407 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF6BO95407 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF6BO95407 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFRSF6BO95407 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFRSF6BO95407 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFRSF6BO95407 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFRSF6BO95407 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFRSF6BO95407 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFRSF6BO95407 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFRSF6BO95407 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF6BO95407 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF6BO95407 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF6BO95407 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF6BO95407 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF6BO95407 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF6BO95407 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF6BO95407 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF6BO95407 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF6BO95407 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFRSF6BO95407 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFRSF6BO95407 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFRSF6BO95407 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFRSF6BO95407 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFRSF6BO95407 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFRSF6BO95407 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFRSF6BO95407 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFRSF6BO95407 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFRSF6BO95407 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFRSF6BO95407 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFRSF6BO95407 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFRSF6BO95407 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF6BO95407 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF6BO95407 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF6BO95407 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF6BO95407 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF6BO95407 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNFRSF6BO95407 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNFRSF6BO95407 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNFRSF6BO95407 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNFRSF6BO95407 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNFRSF6BO95407 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF6BO95407 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF6BO95407 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF6BO95407 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF6BO95407 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF6BO95407 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF6BO95407 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF6BO95407 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF6BO95407 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF6BO95407 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF6BO95407 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF6BO95407 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF6BO95407 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF6BO95407 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF6BO95407 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF6BO95407 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF6BO95407 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF6BO95407 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF6BO95407 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF6BO95407 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF6BO95407 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF6BO95407 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF6BO95407 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF6BO95407 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF6BO95407 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF6BO95407 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF6BO95407 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF6BO95407 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF6BO95407 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF6BO95407 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF6BO95407 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF6BO95407 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF6BO95407 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF6BO95407 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF6BO95407 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF6BO95407 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF6BO95407 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF6BO95407 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF6BO95407 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF6BO95407 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TNFRSF6BO95407 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF6BO95407 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF6BO95407 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF6BO95407 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF6BO95407 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF6BO95407 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TNFRSF6BO95407 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF6BO95407 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF6BO95407 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF6BO95407 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF6BO95407 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF6BO95407 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF6BO95407 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNFRSF6BO95407 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 207 ms