Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC24DO94855 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC24DO94855 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC24DO94855 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC24DO94855 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC24DO94855 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC24DO94855 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC24DO94855 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC24DO94855 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC24DO94855 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC24DO94855 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC24DO94855 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC24DO94855 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC24DO94855 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC24DO94855 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC24DO94855 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC24DO94855 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC24DO94855 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC24DO94855 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC24DO94855 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC24DO94855 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC24DO94855 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC24DO94855 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC24DO94855 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC24DO94855 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC24DO94855 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC24DO94855 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC24DO94855 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC24DO94855 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC24DO94855 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC24DO94855 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC24DO94855 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC24DO94855 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC24DO94855 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC24DO94855 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC24DO94855 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC24DO94855 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC24DO94855 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC24DO94855 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEC24DO94855 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEC24DO94855 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEC24DO94855 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEC24DO94855 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEC24DO94855 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEC24DO94855 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC24DO94855 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC24DO94855 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC24DO94855 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC24DO94855 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC24DO94855 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC24DO94855 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC24DO94855 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC24DO94855 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC24DO94855 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC24DO94855 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC24DO94855 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC24DO94855 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC24DO94855 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC24DO94855 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC24DO94855 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC24DO94855 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC24DO94855 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC24DO94855 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC24DO94855 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC24DO94855 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC24DO94855 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC24DO94855 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC24DO94855 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC24DO94855 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC24DO94855 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC24DO94855 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC24DO94855 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC24DO94855 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC24DO94855 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC24DO94855 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEC24DO94855 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC24DO94855 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC24DO94855 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEC24DO94855 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC24DO94855 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC24DO94855 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC24DO94855 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC24DO94855 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC24DO94855 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC24DO94855 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEC24DO94855 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC24DO94855 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC24DO94855 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC24DO94855 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEC24DO94855 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC24DO94855 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC24DO94855 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEC24DO94855 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEC24DO94855 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEC24DO94855 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SEC24DO94855 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEC24DO94855 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SEC24DO94855 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEC24DO94855 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEC24DO94855 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms