Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SLIT2O94813 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SLIT2O94813 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SLIT2O94813 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SLIT2O94813 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SLIT2O94813 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SLIT2O94813 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SLIT2O94813 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SLIT2O94813 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
SLIT2O94813 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
SLIT2O94813 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
SLIT2O94813 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
SLIT2O94813 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SLIT2O94813 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SLIT2O94813 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SLIT2O94813 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SLIT2O94813 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SLIT2O94813 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
SLIT2O94813 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SLIT2O94813 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SLIT2O94813 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SLIT2O94813 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SLIT2O94813 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
SLIT2O94813 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SLIT2O94813 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SLIT2O94813 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SLIT2O94813 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
SLIT2O94813 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SLIT2O94813 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
SLIT2O94813 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
SLIT2O94813 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
SLIT2O94813 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC34.2■■■■□ 3.06
SLIT2O94813 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SLIT2O94813 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
SLIT2O94813 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SLIT2O94813 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SLIT2O94813 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SLIT2O94813 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SLIT2O94813 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SLIT2O94813 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SLIT2O94813 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SLIT2O94813 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SLIT2O94813 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SLIT2O94813 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SLIT2O94813 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SLIT2O94813 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SLIT2O94813 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SLIT2O94813 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SLIT2O94813 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SLIT2O94813 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SLIT2O94813 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SLIT2O94813 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SLIT2O94813 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SLIT2O94813 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
SLIT2O94813 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
SLIT2O94813 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SLIT2O94813 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SLIT2O94813 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
SLIT2O94813 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SLIT2O94813 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SLIT2O94813 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SLIT2O94813 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SLIT2O94813 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SLIT2O94813 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
SLIT2O94813 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SLIT2O94813 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SLIT2O94813 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SLIT2O94813 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SLIT2O94813 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SLIT2O94813 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SLIT2O94813 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SLIT2O94813 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SLIT2O94813 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
SLIT2O94813 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SLIT2O94813 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SLIT2O94813 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
SLIT2O94813 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SLIT2O94813 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SLIT2O94813 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SLIT2O94813 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
SLIT2O94813 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SLIT2O94813 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SLIT2O94813 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SLIT2O94813 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SLIT2O94813 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SLIT2O94813 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
SLIT2O94813 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SLIT2O94813 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SLIT2O94813 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
SLIT2O94813 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SLIT2O94813 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SLIT2O94813 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SLIT2O94813 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
SLIT2O94813 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SLIT2O94813 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SLIT2O94813 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SLIT2O94813 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
SLIT2O94813 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SLIT2O94813 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
SLIT2O94813 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms