Protein–RNA interactions for Protein: O75309

CDH16, Cadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH16O75309 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDH16O75309 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CDH16O75309 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDH16O75309 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDH16O75309 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDH16O75309 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDH16O75309 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDH16O75309 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDH16O75309 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDH16O75309 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDH16O75309 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDH16O75309 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDH16O75309 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH16O75309 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH16O75309 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH16O75309 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH16O75309 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH16O75309 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH16O75309 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDH16O75309 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDH16O75309 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDH16O75309 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDH16O75309 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDH16O75309 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDH16O75309 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDH16O75309 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDH16O75309 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDH16O75309 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDH16O75309 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDH16O75309 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDH16O75309 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDH16O75309 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDH16O75309 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDH16O75309 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDH16O75309 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDH16O75309 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CDH16O75309 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDH16O75309 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDH16O75309 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDH16O75309 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDH16O75309 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDH16O75309 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH16O75309 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH16O75309 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH16O75309 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH16O75309 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH16O75309 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDH16O75309 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDH16O75309 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDH16O75309 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDH16O75309 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDH16O75309 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDH16O75309 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDH16O75309 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDH16O75309 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CDH16O75309 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH16O75309 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH16O75309 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH16O75309 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDH16O75309 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH16O75309 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH16O75309 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH16O75309 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH16O75309 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH16O75309 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDH16O75309 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDH16O75309 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CDH16O75309 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDH16O75309 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDH16O75309 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDH16O75309 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDH16O75309 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDH16O75309 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDH16O75309 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDH16O75309 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDH16O75309 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDH16O75309 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CDH16O75309 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH16O75309 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH16O75309 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH16O75309 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH16O75309 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH16O75309 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH16O75309 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH16O75309 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH16O75309 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDH16O75309 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDH16O75309 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDH16O75309 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDH16O75309 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CDH16O75309 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDH16O75309 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDH16O75309 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDH16O75309 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CDH16O75309 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDH16O75309 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDH16O75309 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDH16O75309 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDH16O75309 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDH16O75309 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms