Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPFIA3O75145 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PPFIA3O75145 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PPFIA3O75145 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PPFIA3O75145 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PPFIA3O75145 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PPFIA3O75145 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PPFIA3O75145 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PPFIA3O75145 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PPFIA3O75145 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PPFIA3O75145 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PPFIA3O75145 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PPFIA3O75145 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PPFIA3O75145 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PPFIA3O75145 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PPFIA3O75145 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PPFIA3O75145 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PPFIA3O75145 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PPFIA3O75145 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PPFIA3O75145 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PPFIA3O75145 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PPFIA3O75145 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PPFIA3O75145 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PPFIA3O75145 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PPFIA3O75145 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PPFIA3O75145 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PPFIA3O75145 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PPFIA3O75145 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PPFIA3O75145 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PPFIA3O75145 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PPFIA3O75145 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PPFIA3O75145 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PPFIA3O75145 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PPFIA3O75145 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PPFIA3O75145 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PPFIA3O75145 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PPFIA3O75145 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PPFIA3O75145 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PPFIA3O75145 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PPFIA3O75145 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PPFIA3O75145 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PPFIA3O75145 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PPFIA3O75145 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPFIA3O75145 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPFIA3O75145 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PPFIA3O75145 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPFIA3O75145 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PPFIA3O75145 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PPFIA3O75145 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PPFIA3O75145 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PPFIA3O75145 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PPFIA3O75145 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PPFIA3O75145 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PPFIA3O75145 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PPFIA3O75145 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PPFIA3O75145 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PPFIA3O75145 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PPFIA3O75145 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PPFIA3O75145 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PPFIA3O75145 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PPFIA3O75145 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PPFIA3O75145 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PPFIA3O75145 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PPFIA3O75145 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
PPFIA3O75145 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
PPFIA3O75145 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PPFIA3O75145 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PPFIA3O75145 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PPFIA3O75145 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PPFIA3O75145 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PPFIA3O75145 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PPFIA3O75145 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PPFIA3O75145 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PPFIA3O75145 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PPFIA3O75145 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PPFIA3O75145 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PPFIA3O75145 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PPFIA3O75145 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PPFIA3O75145 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PPFIA3O75145 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PPFIA3O75145 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PPFIA3O75145 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PPFIA3O75145 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PPFIA3O75145 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PPFIA3O75145 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PPFIA3O75145 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PPFIA3O75145 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PPFIA3O75145 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PPFIA3O75145 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PPFIA3O75145 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PPFIA3O75145 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PPFIA3O75145 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PPFIA3O75145 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PPFIA3O75145 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PPFIA3O75145 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PPFIA3O75145 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PPFIA3O75145 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PPFIA3O75145 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PPFIA3O75145 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PPFIA3O75145 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.7 ms